More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3432 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  69.41 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  51.56 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  53.11 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  52.11 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  45.36 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  40.87 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  40.87 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  40.87 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  40.87 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  40 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  42.27 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  42.27 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  42.27 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  42.27 
 
 		 211 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  41.71 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  43.81 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  61.05 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  38.1 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  40.84 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  43.52 
 
 		 203 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  41.75 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  62.77 
 
 		 260 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  37.81 
 
 		 278 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  57.29 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  37.7 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  42.11 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  31.71 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  56.88 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  56.88 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  49.57 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  37.85 
 
 		 293 aa  125  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  43.71 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  38.86 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  56.88 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  60.42 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  48.72 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  32.52 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  32.52 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  39.06 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  56 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  50.96 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  60.61 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  32.11 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  54.74 
 
 		 342 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  51.28 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  56.7 
 
 		 415 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  56.7 
 
 		 417 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  35.5 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  51.43 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  49.61 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  57.29 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  37.13 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  43.02 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  54.17 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  55.67 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  53.12 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 315 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  56.44 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 312 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  49.53 
 
 		 474 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  49.53 
 
 		 455 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  48.57 
 
 		 311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 312 aa  118  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 280 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 280 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 280 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  53.61 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  52.08 
 
 		 333 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  49.51 
 
 		 337 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  52.08 
 
 		 332 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  51 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 471 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  58 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  50.47 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  50.51 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  52.43 
 
 		 423 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  46.67 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  47.66 
 
 		 468 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>