More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0879 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1290 aa  2543    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  46.84 
 
 		 1043 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  39.16 
 
 		 1191 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  38.63 
 
 		 1134 aa  433  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  45.38 
 
 		 1092 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  38.69 
 
 		 1143 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  37.48 
 
 		 1124 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  38.81 
 
 		 1146 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  39.52 
 
 		 1165 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  38.18 
 
 		 1069 aa  349  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  39.64 
 
 		 1045 aa  336  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 		 1057 aa  331  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  36.17 
 
 		 1068 aa  327  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  36.92 
 
 		 1048 aa  326  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.65 
 
 		 1052 aa  323  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  37.52 
 
 		 1041 aa  317  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 		 1043 aa  311  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.71 
 
 		 1050 aa  311  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  40.64 
 
 		 1044 aa  310  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  39.77 
 
 		 1034 aa  309  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  38.07 
 
 		 1042 aa  309  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  35.58 
 
 		 1011 aa  298  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  39.17 
 
 		 1039 aa  296  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  35.04 
 
 		 1267 aa  295  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  37.55 
 
 		 1038 aa  295  6e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  34.88 
 
 		 1033 aa  293  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.28 
 
 		 1032 aa  293  2e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1034 aa  293  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0472  acriflavin resistance protein  26 
 
 		 1138 aa  290  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  34.24 
 
 		 1024 aa  287  7e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  34 
 
 		 1038 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  33.16 
 
 		 1044 aa  287  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.32 
 
 		 1496 aa  285  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1044 aa  285  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1028 aa  284  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 		 1032 aa  284  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  35.21 
 
 		 1067 aa  283  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1470 aa  283  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  34.64 
 
 		 1335 aa  281  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  32.74 
 
 		 1189 aa  280  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1028 aa  279  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1028 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1038 aa  272  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1041 aa  268  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  33.86 
 
 		 1028 aa  267  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  32.02 
 
 		 1046 aa  265  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1043 aa  265  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1058 aa  264  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1039 aa  264  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1041 aa  261  8e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1041 aa  259  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1047 aa  259  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1071 aa  259  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1036 aa  259  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1034 aa  258  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1039 aa  258  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  34.03 
 
 		 1033 aa  258  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1073 aa  256  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1062 aa  255  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.3 
 
 		 1049 aa  254  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1040 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1044 aa  253  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 		 1040 aa  253  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1020 aa  252  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1034 aa  251  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1055 aa  251  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1014 aa  250  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  33.08 
 
 		 1092 aa  249  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1051 aa  249  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1051 aa  249  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1046 aa  249  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.47 
 
 		 1024 aa  248  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30 
 
 		 1053 aa  247  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1047 aa  247  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1047 aa  247  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1047 aa  247  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1051 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  30.25 
 
 		 1069 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1058 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1047 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1030 aa  245  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.06 
 
 		 1025 aa  245  3.9999999999999997e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  32.87 
 
 		 1029 aa  244  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.29 
 
 		 1046 aa  243  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1035 aa  243  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 		 1045 aa  243  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1035 aa  243  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1031 aa  242  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1034 aa  242  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1023 aa  242  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4228  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1071 aa  241  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0330177  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 		 1038 aa  241  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 		 1173 aa  241  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.4 
 
 		 1019 aa  241  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1086 aa  241  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1054 aa  240  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.64 
 
 		 1036 aa  240  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1054 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1054 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1036 aa  239  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>