More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0472 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0039  acriflavin resistance protein  66.6 
 
 		 1060 aa  720    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0472  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1138 aa  2286    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4744  acriflavin resistance protein  69.26 
 
 		 1028 aa  748    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  55.66 
 
 		 1048 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4107  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  51.37 
 
 		 1067 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666055  normal  0.120279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3464  Acr family transporter  49.17 
 
 		 1101 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3045  acriflavin resistance protein  49.81 
 
 		 1108 aa  532  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  50.78 
 
 		 1033 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  50.78 
 
 		 1033 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  49.81 
 
 		 1088 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3300  acriflavin resistance protein  49.22 
 
 		 1108 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.992116  normal  0.412729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  49.81 
 
 		 1088 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  50.1 
 
 		 1103 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  51.17 
 
 		 1039 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  50.2 
 
 		 1028 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  49.61 
 
 		 1405 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  49.61 
 
 		 1088 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2927  acriflavin resistance protein  48.98 
 
 		 1009 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  50.39 
 
 		 1037 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  49.32 
 
 		 1018 aa  512  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  48.63 
 
 		 1058 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  48.24 
 
 		 1044 aa  509  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  48.24 
 
 		 1060 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4395  acriflavin resistance protein  51.56 
 
 		 1047 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.882422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  51.17 
 
 		 1036 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  46.85 
 
 		 1036 aa  503  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  48.63 
 
 		 1046 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  47.22 
 
 		 1031 aa  501  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  47.46 
 
 		 1042 aa  498  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  47.02 
 
 		 1031 aa  498  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0885  acriflavin resistance protein  48.26 
 
 		 1053 aa  499  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  47.66 
 
 		 1050 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  47.07 
 
 		 1040 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  47.46 
 
 		 1027 aa  495  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3922  acriflavin resistance protein  51.56 
 
 		 1046 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.081539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  47.07 
 
 		 1031 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4034  acriflavin resistance protein  50.39 
 
 		 1037 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4290  acriflavin resistance protein  51.56 
 
 		 1046 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0982359  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  49.04 
 
 		 1031 aa  492  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1280  acriflavin resistance protein  50.98 
 
 		 1037 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3023  acriflavin resistance protein  48.34 
 
 		 1027 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  46.41 
 
 		 1035 aa  483  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  47.66 
 
 		 1042 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1374  acriflavin resistance protein  49.62 
 
 		 1028 aa  476  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.244767  decreased coverage  0.0000403817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5103  acriflavin resistance protein  50.78 
 
 		 1044 aa  475  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  47.57 
 
 		 1043 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0466  acriflavin resistance protein  49.22 
 
 		 1031 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0468485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0397  acriflavin resistance protein  49.41 
 
 		 1031 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  47.77 
 
 		 1044 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0430  acriflavin resistance protein  49.22 
 
 		 1031 aa  459  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  45.51 
 
 		 1025 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  43.03 
 
 		 1083 aa  455  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  44.44 
 
 		 1032 aa  452  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  44.34 
 
 		 1036 aa  449  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  43.36 
 
 		 1027 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  41.64 
 
 		 1050 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03086  transporter transmembrane protein  44.44 
 
 		 1034 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5659  acriflavin resistance protein  40.17 
 
 		 1022 aa  439  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.891494  normal  0.720908 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7283  Acr family transporter  43.65 
 
 		 1018 aa  439  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2967  acriflavin resistance protein  43.07 
 
 		 1032 aa  436  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0225941 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7483  Acr family transporter  43.56 
 
 		 1027 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  41.83 
 
 		 1044 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2622  acriflavin resistance protein  43.4 
 
 		 1014 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1044 aa  383  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1083 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1082 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1102 aa  361  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  39.39 
 
 		 1038 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1086 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1095 aa  358  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1173 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1087 aa  351  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.83 
 
 		 1091 aa  346  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1087 aa  345  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1087 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1083 aa  342  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.94 
 
 		 1191 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  37.17 
 
 		 1470 aa  342  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1085 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1085 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1085 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1085 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1156 aa  325  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  34.64 
 
 		 1496 aa  325  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  35.45 
 
 		 1041 aa  325  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  35.66 
 
 		 1036 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  24.72 
 
 		 1134 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  35.88 
 
 		 1071 aa  320  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  34.14 
 
 		 1032 aa  320  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 		 1146 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1067 aa  313  9e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1498  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1110 aa  313  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382997  hitchhiker  0.0048852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1065 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 		 1050 aa  311  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  35.52 
 
 		 1069 aa  311  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  34.59 
 
 		 1039 aa  307  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  38.43 
 
 		 1055 aa  306  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 		 1054 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  33.15 
 
 		 1070 aa  306  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  35.61 
 
 		 1054 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>