More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0645 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0645  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1021 aa  1920    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0190397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  34.75 
 
 		 1011 aa  548  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 		 1050 aa  535  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1043 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1044 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1040 aa  498  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  37.28 
 
 		 1017 aa  491  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1034 aa  487  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  33.55 
 
 		 1086 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 		 1085 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1085 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1085 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  33.39 
 
 		 1082 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  32.7 
 
 		 1044 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1023 aa  475  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 		 1034 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  33.36 
 
 		 1102 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 1024 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1044 aa  464  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1046 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1055 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.5 
 
 		 1043 aa  456  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1173 aa  449  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1038 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1027 aa  446  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1041 aa  432  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.55 
 
 		 1049 aa  429  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1032 aa  426  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1041 aa  422  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1095 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1053 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1026 aa  422  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.36 
 
 		 1024 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1038 aa  419  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1036 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1470 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1041 aa  416  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1039 aa  416  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.9 
 
 		 1496 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1050 aa  412  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  28.57 
 
 		 1040 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1041 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  29.22 
 
 		 1006 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 		 1075 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 		 1028 aa  406  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 		 1028 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1070 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1028 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  33.73 
 
 		 1045 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1038 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  26.64 
 
 		 1071 aa  398  1e-109  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 		 1057 aa  399  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1033 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1048 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1022 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1071 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1047 aa  392  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  31.1 
 
 		 1088 aa  393  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 		 1037 aa  392  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.66 
 
 		 1034 aa  393  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1088 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1088 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1046 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1044 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1048 aa  386  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.4 
 
 		 1069 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.69 
 
 		 1024 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2258  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1053 aa  383  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  0.166006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1042 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.83 
 
 		 1036 aa  381  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1051 aa  382  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  29.39 
 
 		 1030 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1028 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3101  multidrug efflux system subunit MdtC  30.87 
 
 		 1024 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0416497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1330  multidrug efflux system subunit MdtC  30.87 
 
 		 1024 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1065 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  30.87 
 
 		 1024 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1059 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1031 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1058 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 		 1034 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  31.2 
 
 		 1023 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.68 
 
 		 1068 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1058 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2968  multidrug efflux system subunit MdtC  29.56 
 
 		 1026 aa  373  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1043 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1066 aa  373  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1026 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  26.77 
 
 		 1012 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1019  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1058 aa  372  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1042 aa  373  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1040 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1050 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1028 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  29.45 
 
 		 1026 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1042 aa  373  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1063 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1037 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  26.74 
 
 		 1012 aa  369  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1058 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>