More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5293 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  77.01 
 
 
262 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  75 
 
 
282 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  75.78 
 
 
259 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  75 
 
 
259 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  66.67 
 
 
262 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  66.04 
 
 
267 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  65.04 
 
 
266 aa  355  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  67.19 
 
 
262 aa  355  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  67.06 
 
 
280 aa  353  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  64.77 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  64.79 
 
 
266 aa  348  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  61.18 
 
 
264 aa  340  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  65.34 
 
 
260 aa  334  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  61.35 
 
 
265 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  59.84 
 
 
278 aa  325  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  59.84 
 
 
288 aa  325  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  57.95 
 
 
267 aa  325  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 
266 aa  325  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  62.55 
 
 
301 aa  324  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.84 
 
 
266 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 
266 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 
266 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 
266 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 
266 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 
266 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 
266 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  60.56 
 
 
316 aa  303  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  56.7 
 
 
315 aa  301  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  55.94 
 
 
305 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  60.63 
 
 
255 aa  299  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  58.85 
 
 
294 aa  296  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  56.52 
 
 
282 aa  292  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  54.76 
 
 
258 aa  292  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  53.16 
 
 
271 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  54.76 
 
 
289 aa  282  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  53.31 
 
 
274 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  53.57 
 
 
269 aa  278  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  52.71 
 
 
267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  51.72 
 
 
274 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  49.62 
 
 
267 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  50.57 
 
 
274 aa  261  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  52.92 
 
 
247 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  45.31 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  47.2 
 
 
259 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  43.13 
 
 
265 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  46.77 
 
 
257 aa  218  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  44.9 
 
 
249 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  44.84 
 
 
266 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  45.2 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  44.03 
 
 
274 aa  215  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.49 
 
 
259 aa  215  5e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  43.92 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  44.71 
 
 
284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  43.94 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  44.58 
 
 
265 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.76 
 
 
268 aa  212  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  44.09 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  45.53 
 
 
264 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  46.46 
 
 
272 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  46.37 
 
 
244 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  40.98 
 
 
260 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
260 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  44.13 
 
 
260 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  44.13 
 
 
265 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  45.77 
 
 
265 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  43.03 
 
 
260 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  41.37 
 
 
263 aa  205  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  44.18 
 
 
257 aa  204  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  44.94 
 
 
260 aa  204  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.95 
 
 
258 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  43.55 
 
 
260 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  43.95 
 
 
258 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  44.72 
 
 
258 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  42.29 
 
 
258 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  41.96 
 
 
255 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  43.72 
 
 
243 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  42.06 
 
 
260 aa  201  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  41.8 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  44.31 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  41.73 
 
 
294 aa  198  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  41 
 
 
245 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  45.08 
 
 
273 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  43.7 
 
 
274 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  44.66 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  41.46 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  40.24 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
250 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  42.56 
 
 
266 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  44.53 
 
 
254 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.15 
 
 
503 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  42.8 
 
 
254 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  42.8 
 
 
259 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.93 
 
 
273 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  41.02 
 
 
254 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  40.33 
 
 
253 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
261 aa  191  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 
265 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  40.08 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>