88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3432 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 153 aa  313  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  42.31 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.31 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  42.5 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  38.38 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 307 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  38.38 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  32.14 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2197  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 331 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1010  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0552  tetratricopeptide repeat domain protein  31.58 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.404924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.94 
 
 		 863 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3065  hypothetical protein  26.8 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0081027  normal  0.712309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2801  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318638  normal  0.053059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  41.94 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  28.33 
 
 		 648 aa  48.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  29.7 
 
 		 729 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  34.38 
 
 		 725 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 3145 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  36.25 
 
 		 1764 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 		 624 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 587 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 643 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  42.11 
 
 		 884 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  29.46 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  37.04 
 
 		 467 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  33.33 
 
 		 887 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.45 
 
 		 1056 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3395  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.94 
 
 		 652 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105857  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  35.56 
 
 		 306 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.81 
 
 		 689 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  38.98 
 
 		 706 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 284 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 290 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  35.94 
 
 		 622 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  28.04 
 
 		 540 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  38.89 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30.77 
 
 		 581 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  35.82 
 
 		 905 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1844  hypothetical protein  32.97 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.35393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 3172 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  30 
 
 		 681 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 762 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0930  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 456 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139996  normal  0.100238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 409 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  34.67 
 
 		 462 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  38.81 
 
 		 582 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  28.39 
 
 		 575 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 265 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  30.4 
 
 		 837 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2222  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 374 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  29.51 
 
 		 1013 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 639 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 739 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4997  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.88 
 
 		 248 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3510  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.429554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 1402 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 612 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 792 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 883 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 1737 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.47 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 594 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 265 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.2 
 
 		 3590 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  34.67 
 
 		 334 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 3301 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1481  MCP methyltransferase, CheR-type  32.56 
 
 		 513 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.24 
 
 		 545 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6312  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 380 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.874515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 708 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  34.25 
 
 		 550 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  39.29 
 
 		 638 aa  40.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 817 aa  40.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 149 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>