More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0371 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0371  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  hitchhiker  0.00259911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0403  transcriptional regulator, LysR family  94.12 
 
 		 289 aa  554  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0306  LysR family transcriptional regulator  69.79 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0805  transcriptional regulator LysR family  58.39 
 
 		 301 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1124  transcriptional regulator, LysR family  41.4 
 
 		 288 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0971  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0661405  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2521  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0205  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5812  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0557291 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  28.57 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.06 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4156  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.638472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  29.31 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  31.63 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  32.53 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  32.61 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  27.15 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  28.34 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  29.31 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  26.82 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0572  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 314 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  28.34 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.23 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1150  LysR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 332 aa  92.8  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1617  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3308  transcription regulator protein  28.06 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3661  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0821537  normal  0.180517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  27.67 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5859  transcriptional regulator, LysR family  25.67 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 293 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  27.87 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  29.08 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>