More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0971 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0971  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0661405  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1124  transcriptional regulator, LysR family  92.33 
 
 		 288 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0371  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  hitchhiker  0.00259911 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5812  LysR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0557291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0403  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0306  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0805  transcriptional regulator LysR family  36.49 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2521  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0205  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  29.24 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 313 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4156  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.638472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  27.76 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 328 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 328 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 290 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  27.84 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.27 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  25.91 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0572  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  27.24 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  25.61 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  25.84 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  25.27 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3178  transcriptional regulator, LysR family  26.18 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  27.61 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  25.98 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>