More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0403 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0403  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0371  transcriptional regulator, LysR family  94.12 
 
 		 289 aa  554  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  hitchhiker  0.00259911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0306  LysR family transcriptional regulator  68.86 
 
 		 291 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0805  transcriptional regulator LysR family  58.74 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1124  transcriptional regulator, LysR family  41.05 
 
 		 288 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0971  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0661405  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2521  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0205  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5812  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0557291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  27.57 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.52 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 307 aa  99  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  29.45 
 
 		 334 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  32.42 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 311 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1617  transcriptional regulator, LysR family  32.47 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.564468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1150  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  26.8 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4156  transcriptional regulator, LysR family  25.76 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.638472 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  29.5 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  30.62 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.31 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5859  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  20.46 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3308  transcription regulator protein  25.9 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  24.92 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0572  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3661  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0821537  normal  0.180517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  26.06 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1915  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.86 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>