More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4279 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  74.17 
 
 		 336 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  77.96 
 
 		 331 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  71.43 
 
 		 332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  69.11 
 
 		 331 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  69.05 
 
 		 324 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  43.48 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  41.61 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  40.27 
 
 		 327 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  39.86 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  40.75 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  39.63 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  38.7 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  38.7 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  37.65 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  39.26 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  38.72 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  34.97 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  34.89 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  34.36 
 
 		 335 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  38.31 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  41.29 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  34.98 
 
 		 318 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  38.97 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  34.81 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.93 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.41 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  34.15 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  37.5 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  38.76 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  38.14 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  34.65 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  38.52 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  34.09 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  33.13 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  34.02 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  36.07 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.52 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.55 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  34.65 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  33.74 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  32.52 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  33.88 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  36.64 
 
 		 314 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  36.21 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21240  hypothetical protein  35.1 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00058939  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  35.93 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.15 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  33.56 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  36.19 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  36.09 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  35.14 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.92 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  35.61 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  37.31 
 
 		 332 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  37.93 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  33.55 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  27.54 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  33.11 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  31.72 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  32.88 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  32.64 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2286  hypothetical protein  33.45 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  34.74 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  37.65 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  36.49 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  35.21 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  33.72 
 
 		 325 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  34.68 
 
 		 332 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  32.54 
 
 		 317 aa  149  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  33.8 
 
 		 319 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.17 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  35.8 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  30.74 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  35.02 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  38.56 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  32.33 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  34.89 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  36.09 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  38.61 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4951  extra-cytoplasmic solute receptor  37.76 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  31.86 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  34.8 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  38.76 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  33.24 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  31.89 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.91 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  34.5 
 
 		 322 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4798  hypothetical protein  34.82 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.177253  normal  0.0723657 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.63 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  33.54 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  34.86 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  34.73 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  32.83 
 
 		 316 aa  146  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  35.57 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>