More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2799 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  37.4 
 
 		 1008 aa  679    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  40.11 
 
 		 1069 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  46.55 
 
 		 1089 aa  966    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  41.42 
 
 		 1016 aa  762    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  41.75 
 
 		 1065 aa  931    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  54.07 
 
 		 1059 aa  1081    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  100 
 
 		 1117 aa  2258    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  82.91 
 
 		 1104 aa  1880    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  35.85 
 
 		 1183 aa  632  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  35.91 
 
 		 1181 aa  622  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  36.83 
 
 		 1147 aa  611  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  38.02 
 
 		 1051 aa  602  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  30.74 
 
 		 1354 aa  554  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  35.2 
 
 		 1107 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  32.86 
 
 		 1186 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  32.44 
 
 		 1167 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  28.3 
 
 		 1079 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  29 
 
 		 1075 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  30.64 
 
 		 1084 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  28.78 
 
 		 1094 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  28.3 
 
 		 1094 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  28.65 
 
 		 1093 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  28.38 
 
 		 1093 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  28.65 
 
 		 1093 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  28.43 
 
 		 1094 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  28.52 
 
 		 1094 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  28.85 
 
 		 1097 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  28.34 
 
 		 1094 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  28.34 
 
 		 1094 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  29.26 
 
 		 1104 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  27.51 
 
 		 1092 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  28.35 
 
 		 1094 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  27.31 
 
 		 1094 aa  379  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  28.27 
 
 		 1067 aa  291  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.94 
 
 		 1082 aa  282  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  27.74 
 
 		 1090 aa  279  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.88 
 
 		 1097 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  30.89 
 
 		 1193 aa  178  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  30.32 
 
 		 1545 aa  167  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  25.93 
 
 		 1125 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  30.09 
 
 		 1545 aa  166  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  33.48 
 
 		 1484 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.78 
 
 		 1084 aa  119  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  23.98 
 
 		 1076 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  25.18 
 
 		 428 aa  101  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.16 
 
 		 425 aa  92  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  24.17 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  23.96 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  23.15 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.58 
 
 		 362 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.07 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  24.62 
 
 		 389 aa  66.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  25.06 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  22.97 
 
 		 397 aa  63.9  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  42.68 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  22.66 
 
 		 465 aa  63.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  42.68 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  31.07 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  23.04 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  42.68 
 
 		 434 aa  62  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 		 449 aa  62  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  37.78 
 
 		 437 aa  62  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  30.06 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  37.5 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  23.39 
 
 		 1066 aa  61.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  23.37 
 
 		 426 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.58 
 
 		 660 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 423 aa  60.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.82 
 
 		 590 aa  60.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  26.23 
 
 		 442 aa  60.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  24.32 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  23.56 
 
 		 1067 aa  59.3  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 		 969 aa  58.9  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  32.5 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  36.11 
 
 		 956 aa  58.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.92 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  27.96 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.28 
 
 		 1071 aa  58.2  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  22.05 
 
 		 409 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  22.8 
 
 		 1069 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.53 
 
 		 677 aa  57.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  26.49 
 
 		 444 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  23.74 
 
 		 1010 aa  57.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.17 
 
 		 726 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  23.51 
 
 		 423 aa  57  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  33.12 
 
 		 430 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  31.82 
 
 		 444 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.38 
 
 		 407 aa  57  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  33.12 
 
 		 430 aa  56.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  31.82 
 
 		 444 aa  56.2  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  27.62 
 
 		 449 aa  56.2  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  30.3 
 
 		 1005 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  31.82 
 
 		 444 aa  56.2  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 444 aa  56.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  25.41 
 
 		 440 aa  56.2  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.57 
 
 		 438 aa  56.2  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0365  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40.91 
 
 		 664 aa  56.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.21 
 
 		 674 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.37 
 
 		 407 aa  55.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>