More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6101 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 214 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  99.07 
 
 		 214 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  82.74 
 
 		 219 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  57.77 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  60.94 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  55.88 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  50.98 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  53.88 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  53.85 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  48.73 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  48.73 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  47.78 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  61.98 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.13 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  50.82 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  50.82 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  50.82 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 		 197 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 		 213 aa  174  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  46.12 
 
 		 347 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  40.2 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  46.12 
 
 		 341 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.84 
 
 		 370 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43 
 
 		 359 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.15 
 
 		 378 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.15 
 
 		 378 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  46.15 
 
 		 358 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.15 
 
 		 378 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.15 
 
 		 378 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  43.48 
 
 		 359 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.15 
 
 		 378 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.15 
 
 		 378 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  43.69 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.62 
 
 		 378 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2120  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.84 
 
 		 380 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674614  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  46.81 
 
 		 338 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.23 
 
 		 372 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.62 
 
 		 378 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.62 
 
 		 378 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.62 
 
 		 378 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  41.9 
 
 		 368 aa  148  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03940  polyamine transport protein PotG  43.07 
 
 		 384 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  41.95 
 
 		 353 aa  148  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.92 
 
 		 387 aa  148  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0393  polyamine transport protein PotG  43.07 
 
 		 384 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.49 
 
 		 373 aa  147  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.01 
 
 		 378 aa  147  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.12 
 
 		 360 aa  147  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.81 
 
 		 352 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.33 
 
 		 363 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.57 
 
 		 384 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 380 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  49.48 
 
 		 357 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  44.81 
 
 		 350 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  41.12 
 
 		 336 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.57 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 353 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  42.79 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8158  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  46.56 
 
 		 377 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  43 
 
 		 356 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  43.85 
 
 		 353 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.57 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.54 
 
 		 372 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 380 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 382 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  38.79 
 
 		 350 aa  145  3e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  42.23 
 
 		 351 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  38.94 
 
 		 349 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  43.81 
 
 		 353 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  43.33 
 
 		 362 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  42.86 
 
 		 347 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  42.79 
 
 		 363 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.76 
 
 		 359 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  37.63 
 
 		 367 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.01 
 
 		 376 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.68 
 
 		 363 aa  145  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 367 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.16 
 
 		 351 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5239  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.58 
 
 		 380 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.5 
 
 		 356 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.2 
 
 		 372 aa  144  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.13 
 
 		 349 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 390 aa  144  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3008  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.62 
 
 		 378 aa  144  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.05 
 
 		 377 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.5 
 
 		 378 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  43.68 
 
 		 356 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.03 
 
 		 363 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  42.11 
 
 		 366 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.56 
 
 		 447 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  38.71 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.09 
 
 		 377 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.43 
 
 		 359 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>