More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3276 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  65.22 
 
 		 213 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  57.69 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  50.45 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  60.48 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  50.96 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  56.37 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  54.36 
 
 		 219 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  55.88 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 220 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  49.47 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  46.41 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  45.23 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  45.23 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  45.23 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  51.31 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  42.18 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  42.18 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.79 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  38.97 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.37 
 
 		 377 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  44.06 
 
 		 353 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.92 
 
 		 363 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.55 
 
 		 374 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 354 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 367 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  38.05 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0682  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 		 337 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  41.1 
 
 		 358 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  38.76 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  43.68 
 
 		 375 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  38.99 
 
 		 363 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1864  ABC transporter related  42.31 
 
 		 361 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 371 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  40.49 
 
 		 356 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  38.28 
 
 		 349 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.17 
 
 		 348 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  42.78 
 
 		 353 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.31 
 
 		 360 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  41.18 
 
 		 376 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.76 
 
 		 376 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.29 
 
 		 349 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  38.21 
 
 		 366 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.29 
 
 		 359 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.35 
 
 		 356 aa  140  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1404  ABC transporter related  37.86 
 
 		 356 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0478366  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  40.86 
 
 		 366 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  41.4 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0570  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.09 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  40.58 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  41.4 
 
 		 363 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 374 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.24 
 
 		 338 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  40.29 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  38.05 
 
 		 372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  41.46 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  43.32 
 
 		 357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  38.35 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  38.05 
 
 		 372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  39.51 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  43.59 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  39.81 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  41.78 
 
 		 350 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  39.13 
 
 		 415 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  39.51 
 
 		 366 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.31 
 
 		 358 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  43.75 
 
 		 363 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  39.37 
 
 		 359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  43.37 
 
 		 361 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  39.29 
 
 		 375 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  41.31 
 
 		 348 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  41.31 
 
 		 343 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 375 aa  138  6e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.68 
 
 		 345 aa  138  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2481  ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 325 aa  138  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4990  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.31 
 
 		 363 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  40.29 
 
 		 337 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 358 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 343 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 		 333 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.13 
 
 		 380 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  41.18 
 
 		 359 aa  138  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  37.86 
 
 		 353 aa  138  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  38.54 
 
 		 353 aa  137  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 353 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 		 351 aa  137  1e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 		 343 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.1 
 
 		 327 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.76 
 
 		 360 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  40.64 
 
 		 353 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  38.92 
 
 		 347 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4324  ABC transporter related  40.29 
 
 		 368 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0269619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 		 357 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>