More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  100 
 
 		 348 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0748  ABC transporter related  59.65 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0435  ABC transporter related  51.92 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0316  ABC transporter related  54.55 
 
 		 342 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.000000000465057  decreased coverage  0.0034539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  41.34 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3054  ABC transporter related protein  50 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.374773  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3807  ABC transporter related  50 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04180  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  60.62 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.40669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.9 
 
 		 345 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0180  ABC transporter related protein  58.13 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  42.02 
 
 		 356 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  49.03 
 
 		 357 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.64 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.72 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  49.38 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2400  ABC transporter related  47.29 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.91 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.24 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.16 
 
 		 357 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 		 365 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.38 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  50.41 
 
 		 355 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4066  ABC transporter related  44.44 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549495  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  53.88 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  50.45 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6092  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (polyamine)  50.21 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4466  ABC transporter-like  46.59 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  46.64 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  39.93 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.79 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.051022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  44.93 
 
 		 357 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  48.05 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  48.67 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.9 
 
 		 352 aa  228  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  40.33 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  52.05 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  48.7 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  48.7 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  48.7 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  41.67 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  47.9 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  35.59 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  37.97 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.69 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.75 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  40.7 
 
 		 363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.64 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.06 
 
 		 381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  50 
 
 		 363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  46.1 
 
 		 356 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 384 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.64 
 
 		 384 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.64 
 
 		 384 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 347 aa  226  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.75 
 
 		 386 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  44.48 
 
 		 363 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.77 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.03 
 
 		 363 aa  225  9e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.41 
 
 		 388 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  46.69 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.25 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.52 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.62 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.17 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.19 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  48.87 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.22 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.93 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.19 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.19 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.98 
 
 		 361 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.64 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.64 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  43.25 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 		 388 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  44.97 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  48.91 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.95 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  47.15 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.22 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.57 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.98 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 378 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3171  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.659319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0902  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.82 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>