More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1444 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  100 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  81.78 
 
 		 214 aa  309  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  81.31 
 
 		 214 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  57.77 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  55.39 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  49.51 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  54.29 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  63.02 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  58.12 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  49.51 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  45.81 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  50.53 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  47.62 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  48.91 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  48.91 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  48.91 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  48.91 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 		 197 aa  178  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.96 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  47.12 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  45.24 
 
 		 342 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  45.71 
 
 		 341 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.98 
 
 		 374 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.2 
 
 		 363 aa  161  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.33 
 
 		 370 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  43.87 
 
 		 353 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  44.95 
 
 		 353 aa  158  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 382 aa  158  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.12 
 
 		 360 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  45.45 
 
 		 375 aa  157  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 		 349 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  43.19 
 
 		 347 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  41.29 
 
 		 349 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  45.97 
 
 		 347 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  46.5 
 
 		 324 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.42 
 
 		 352 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  46 
 
 		 371 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  46.07 
 
 		 361 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  46.07 
 
 		 361 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  46.07 
 
 		 361 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 343 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 349 aa  155  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 		 372 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  42.31 
 
 		 351 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  41.4 
 
 		 367 aa  154  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 		 359 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.15 
 
 		 376 aa  154  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 379 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 363 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  42.93 
 
 		 353 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  45.96 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 367 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 378 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  43.6 
 
 		 352 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  45.96 
 
 		 360 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 353 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  43.23 
 
 		 360 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.86 
 
 		 373 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  44.33 
 
 		 338 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.78 
 
 		 393 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  46.46 
 
 		 360 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  45.96 
 
 		 360 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  46.46 
 
 		 360 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  44.44 
 
 		 362 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8158  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  45.31 
 
 		 377 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  43.23 
 
 		 363 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  45.96 
 
 		 358 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 378 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  46.5 
 
 		 340 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  42.42 
 
 		 353 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03940  polyamine transport protein PotG  42.16 
 
 		 384 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2333  ABC transporter related protein  43.3 
 
 		 361 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0393  polyamine transport protein PotG  42.16 
 
 		 384 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  44.56 
 
 		 350 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 356 aa  151  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.45 
 
 		 378 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 		 377 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  45.96 
 
 		 346 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.07 
 
 		 341 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  48.47 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.7 
 
 		 372 aa  151  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  45.96 
 
 		 346 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.77 
 
 		 363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 378 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 378 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.99 
 
 		 356 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 378 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.79 
 
 		 352 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 378 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15311  ABC transporter for sugars, ATP binding protein  45.6 
 
 		 322 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 		 363 aa  151  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 378 aa  151  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>