More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2961 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  69.42 
 
 		 208 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  54.03 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  50.45 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  52.43 
 
 		 213 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.34 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  50.98 
 
 		 214 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  50.98 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  50 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  46.12 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  47.34 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  49.73 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  49.73 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  49.73 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  48.63 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  49.73 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  53.45 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  43.37 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  45.51 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 220 aa  168  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  48.54 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 346 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 343 aa  148  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  41.29 
 
 		 342 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  42.78 
 
 		 349 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  42.78 
 
 		 349 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  43.59 
 
 		 357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  43.28 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  40.11 
 
 		 342 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  43.78 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  42.25 
 
 		 349 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 		 326 aa  142  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  42.25 
 
 		 349 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.78 
 
 		 348 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41.84 
 
 		 360 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  41.71 
 
 		 349 aa  141  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.27 
 
 		 363 aa  141  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  43.68 
 
 		 369 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  45.9 
 
 		 368 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  42.13 
 
 		 356 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  36.46 
 
 		 349 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  41.49 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.02 
 
 		 363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4066  ABC transporter related  40.76 
 
 		 379 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549495  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  44.74 
 
 		 369 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.58 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  40 
 
 		 372 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 339 aa  138  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  40 
 
 		 339 aa  138  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  45.16 
 
 		 235 aa  137  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.11 
 
 		 349 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44 
 
 		 372 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 		 372 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  43.59 
 
 		 369 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0593  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.21 
 
 		 360 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  40.11 
 
 		 349 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  44.85 
 
 		 366 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  40.11 
 
 		 349 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  41.3 
 
 		 347 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  37.31 
 
 		 330 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  37.31 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  42.19 
 
 		 358 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  41.79 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  38.92 
 
 		 355 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  38.74 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.79 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.66 
 
 		 408 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  40.11 
 
 		 358 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  36.46 
 
 		 348 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  39.27 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 330 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  36.46 
 
 		 348 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  39.89 
 
 		 356 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  38.74 
 
 		 356 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  40.11 
 
 		 349 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 383 aa  135  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  39.8 
 
 		 342 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.99 
 
 		 381 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  39.3 
 
 		 343 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4045  ABC transporter related  41.88 
 
 		 367 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.25 
 
 		 376 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 330 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 318 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  36.68 
 
 		 330 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 318 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  36.08 
 
 		 348 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  38.21 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 330 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 330 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  37.88 
 
 		 356 aa  135  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  38.03 
 
 		 343 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  38.79 
 
 		 355 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.31 
 
 		 364 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>