More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0613 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
235 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  80 
 
 
232 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  80 
 
 
232 aa  381  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  79.57 
 
 
232 aa  381  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  79.13 
 
 
232 aa  377  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  79.57 
 
 
232 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  79.57 
 
 
232 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  79.57 
 
 
232 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  78.02 
 
 
235 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.051764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  78.11 
 
 
235 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  77.68 
 
 
235 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  77.25 
 
 
235 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  79.13 
 
 
232 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  78.26 
 
 
232 aa  370  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  76.82 
 
 
235 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  65.81 
 
 
234 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  68.1 
 
 
236 aa  323  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  68.1 
 
 
236 aa  323  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  68.1 
 
 
236 aa  322  4e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.525623 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  66.67 
 
 
236 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  66.09 
 
 
234 aa  318  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0582  thiamine transporter ATP-binding subunit  65.65 
 
 
230 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0621  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.04 
 
 
237 aa  295  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  54.26 
 
 
234 aa  252  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00790  hypothetical protein  52.89 
 
 
234 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1011  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.45 
 
 
214 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  53 
 
 
238 aa  241  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  48.4 
 
 
224 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  48.8 
 
 
236 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  53.66 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1759  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50 
 
 
241 aa  215  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1698  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
241 aa  215  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  48.83 
 
 
235 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2816  ABC transporter related  50 
 
 
231 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.792279  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1140  ABC transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 
258 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.083935  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4268  thiamine ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
249 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  42.79 
 
 
229 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0060  ABC transporter related  48.86 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1393  ABC thiamine transporter, ATPase subunit  48.4 
 
 
231 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2800  ABC transporter related  50 
 
 
231 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.43358  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  44.02 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1198  ABC transporter related  48.72 
 
 
204 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  43.84 
 
 
347 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.21 
 
 
377 aa  165  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
377 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
377 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
377 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
377 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
346 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2551  ABC transporter related  44.5 
 
 
347 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 
378 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 
378 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
368 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.98 
 
 
377 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3470  ABC transporter related  51.37 
 
 
248 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 
378 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 
378 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  41.9 
 
 
360 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.1 
 
 
378 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
378 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1055  ABC transporter related  43.52 
 
 
366 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.54 
 
 
370 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  44.21 
 
 
359 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
378 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 
378 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 
378 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  44.02 
 
 
349 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.85 
 
 
360 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.83 
 
 
387 aa  158  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  38.39 
 
 
331 aa  158  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
378 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
378 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
378 aa  158  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 
400 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  38.74 
 
 
368 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.03 
 
 
351 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.19 
 
 
375 aa  158  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.54 
 
 
372 aa  157  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.21 
 
 
377 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  42.63 
 
 
358 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
360 aa  158  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  40.48 
 
 
527 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 
377 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 
377 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  40.48 
 
 
363 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 
340 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.5 
 
 
357 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 
378 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 
377 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.74 
 
 
399 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  42.11 
 
 
359 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  40.95 
 
 
360 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  40.95 
 
 
360 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
344 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
348 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  43.3 
 
 
334 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.72 
 
 
390 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5881  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  41.9 
 
 
369 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
379 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>