More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001684 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00790  hypothetical protein  85.41 
 
 		 234 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  68.67 
 
 		 238 aa  336  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  56.22 
 
 		 236 aa  281  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  56.82 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  54.26 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.525623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  54.33 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  54.33 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  54.33 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  51.35 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.23 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  53.85 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  49.57 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  53.37 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  53.37 
 
 		 235 aa  228  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.88 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.051764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.88 
 
 		 235 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0582  thiamine transporter ATP-binding subunit  53.37 
 
 		 230 aa  227  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0621  thiamine transporter ATP-binding subunit  50.68 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.4 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1011  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  43.42 
 
 		 246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1759  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.72 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1698  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1140  ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.083935  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  48.08 
 
 		 229 aa  187  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4268  thiamine ABC transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2816  ABC transporter related  44.23 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.792279  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0060  ABC transporter related  44.7 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1198  ABC transporter related  44.33 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1393  ABC thiamine transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  42.18 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  42.06 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  40.69 
 
 		 358 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  38.1 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  41.31 
 
 		 359 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  37.38 
 
 		 379 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  40.37 
 
 		 527 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  39.56 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  37.5 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  37.23 
 
 		 368 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 		 353 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  38.6 
 
 		 342 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.18 
 
 		 377 aa  158  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 393 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2800  ABC transporter related  42.86 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.43358  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.81 
 
 		 373 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  42.18 
 
 		 359 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  37.61 
 
 		 363 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 378 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.97 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.15 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.04 
 
 		 354 aa  156  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  37.45 
 
 		 361 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  37.84 
 
 		 350 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 329 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  38.6 
 
 		 363 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  37.45 
 
 		 361 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 		 346 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.32 
 
 		 367 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.57 
 
 		 373 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.76 
 
 		 356 aa  155  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  39.06 
 
 		 355 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  36.64 
 
 		 349 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  41.71 
 
 		 363 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.28 
 
 		 368 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 		 352 aa  154  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 378 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  40.28 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 		 378 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  39.17 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  37.61 
 
 		 366 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.48 
 
 		 390 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  36.93 
 
 		 363 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  40.77 
 
 		 367 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1576  ABC transporter related  42.16 
 
 		 381 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  36.6 
 
 		 361 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  38.2 
 
 		 365 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 		 378 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 		 378 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 		 378 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4066  ABC transporter related  39.91 
 
 		 379 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549495  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 		 378 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 379 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 		 378 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 		 378 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 		 378 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  36.48 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6112  ABC transporter related  38.39 
 
 		 368 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>