More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3810 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  97.01 
 
 		 236 aa  461  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0582  thiamine transporter ATP-binding subunit  75.65 
 
 		 230 aa  355  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0621  thiamine transporter ATP-binding subunit  73.93 
 
 		 237 aa  353  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  72.73 
 
 		 234 aa  342  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  70.82 
 
 		 236 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  70.82 
 
 		 236 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  70.39 
 
 		 236 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.525623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  66.09 
 
 		 235 aa  318  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.77 
 
 		 232 aa  310  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  62.34 
 
 		 232 aa  308  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  62.34 
 
 		 232 aa  308  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  61.9 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  61.9 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  61.9 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  61.9 
 
 		 232 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  61.47 
 
 		 232 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  61.04 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.61 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.17 
 
 		 235 aa  298  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.17 
 
 		 235 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.051764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.17 
 
 		 235 aa  297  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  61.74 
 
 		 235 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1011  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.97 
 
 		 214 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.92 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  51.35 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00790  hypothetical protein  52.36 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  50.48 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  49.56 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  49.53 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2816  ABC transporter related  48.4 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.792279  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1698  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 241 aa  197  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1759  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.88 
 
 		 241 aa  197  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00111297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  43.95 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  46.38 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1140  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.083935  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4268  thiamine ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0060  ABC transporter related  49.31 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1393  ABC thiamine transporter, ATPase subunit  48.85 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2800  ABC transporter related  47.93 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.43358  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3470  ABC transporter related  47.17 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 368 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1198  ABC transporter related  45.13 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  42 
 
 		 357 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  41.94 
 
 		 368 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1055  ABC transporter related  41.33 
 
 		 366 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.3 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 367 aa  154  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.35 
 
 		 378 aa  154  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.09 
 
 		 381 aa  154  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.27 
 
 		 367 aa  154  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.81 
 
 		 356 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  42.05 
 
 		 527 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  38.43 
 
 		 349 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.48 
 
 		 370 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  41.47 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.81 
 
 		 368 aa  152  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  37.93 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0435  ABC transporter related  38.17 
 
 		 453 aa  151  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  43.84 
 
 		 326 aa  151  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 		 378 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  43.98 
 
 		 350 aa  150  1e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  44.44 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.63 
 
 		 386 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 		 367 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  42.05 
 
 		 375 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  40.31 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 370 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  42.49 
 
 		 353 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2803  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.9 
 
 		 362 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0416971  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  40.31 
 
 		 348 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  38.89 
 
 		 368 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6112  ABC transporter related  39.62 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  37.81 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 		 372 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.85 
 
 		 402 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  38.5 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  37.25 
 
 		 379 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.71 
 
 		 378 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 386 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 353 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.52 
 
 		 382 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 386 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  36.36 
 
 		 342 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  38.6 
 
 		 357 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  37.14 
 
 		 331 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 386 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 378 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 386 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 386 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 378 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 378 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.41 
 
 		 378 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  36.28 
 
 		 371 aa  149  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.45 
 
 		 380 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 386 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  39.8 
 
 		 346 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  40.53 
 
 		 359 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.05 
 
 		 387 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.33 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>