More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3261 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
246 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1759  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.44 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1698  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  61.44 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1140  ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 
258 aa  277  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.083935  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4268  thiamine ABC transporter ATP-binding protein  53.64 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  56.73 
 
 
235 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.051764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  55.07 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  55.07 
 
 
235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  56.25 
 
 
235 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  53.66 
 
 
235 aa  219  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  52.91 
 
 
232 aa  218  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  52.91 
 
 
232 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  54.59 
 
 
235 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  52.91 
 
 
232 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.91 
 
 
232 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.91 
 
 
232 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.91 
 
 
232 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.91 
 
 
232 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  50.88 
 
 
236 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  50.88 
 
 
236 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.91 
 
 
232 aa  217  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  52.91 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  49.36 
 
 
235 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
236 aa  215  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.525623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0582  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.72 
 
 
230 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
236 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2816  ABC transporter related  51.92 
 
 
231 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.792279  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 
238 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  46.7 
 
 
224 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0621  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.98 
 
 
237 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  45.16 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  43.42 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00790  hypothetical protein  43.86 
 
 
234 aa  198  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  50.25 
 
 
229 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0060  ABC transporter related  50.93 
 
 
231 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1393  ABC thiamine transporter, ATPase subunit  50.46 
 
 
231 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1011  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1198  ABC transporter related  46.5 
 
 
204 aa  177  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  40.43 
 
 
369 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.52 
 
 
390 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  40.43 
 
 
369 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  40.43 
 
 
369 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  40.43 
 
 
369 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  40.43 
 
 
369 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2800  ABC transporter related  47.27 
 
 
231 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.43358  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.59 
 
 
370 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 
382 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  41.6 
 
 
357 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  41.94 
 
 
347 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.6 
 
 
372 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 
380 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.4 
 
 
360 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 
378 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
340 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  40 
 
 
368 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4942  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
339 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0955475  normal  0.393607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
378 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
357 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  43.16 
 
 
351 aa  158  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  38.15 
 
 
360 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.83 
 
 
381 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3470  ABC transporter related  43.9 
 
 
248 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 
355 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  37.34 
 
 
353 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  45.02 
 
 
358 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1055  ABC transporter related  39.42 
 
 
366 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.62 
 
 
387 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  40.44 
 
 
343 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
378 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
378 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
378 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
361 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
378 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  44.72 
 
 
373 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.03 
 
 
352 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
368 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  44.06 
 
 
542 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.62 
 
 
378 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.72 
 
 
377 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3008  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 
378 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  40.59 
 
 
355 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  42.35 
 
 
344 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2120  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.82 
 
 
380 aa  154  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674614  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  39.72 
 
 
349 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
378 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
378 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
378 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
378 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.63 
 
 
344 aa  154  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.72 
 
 
336 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.99 
 
 
364 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  36.48 
 
 
371 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4066  ABC transporter related  44.33 
 
 
379 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549495  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.79 
 
 
367 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.72 
 
 
360 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.72 
 
 
366 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.44 
 
 
380 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.89 
 
 
380 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>