More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3416 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 236 aa  473  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 236 aa  473  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  99.58 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.525623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  77.83 
 
 		 234 aa  360  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  70.82 
 
 		 234 aa  338  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  71.74 
 
 		 236 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  68.1 
 
 		 235 aa  323  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  65.11 
 
 		 235 aa  313  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  65.11 
 
 		 235 aa  312  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  65.11 
 
 		 235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.051764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  64.68 
 
 		 235 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0621  thiamine transporter ATP-binding subunit  70.97 
 
 		 237 aa  310  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0582  thiamine transporter ATP-binding subunit  67.53 
 
 		 230 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  65.52 
 
 		 235 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.48 
 
 		 232 aa  307  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  63.48 
 
 		 232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  63.48 
 
 		 232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.48 
 
 		 232 aa  305  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.48 
 
 		 232 aa  305  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.48 
 
 		 232 aa  305  6e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.48 
 
 		 232 aa  304  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.48 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  63.48 
 
 		 232 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.06 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00790  hypothetical protein  51.93 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  50.21 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1011  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  50.68 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  52.4 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  50.88 
 
 		 246 aa  218  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2816  ABC transporter related  50.68 
 
 		 231 aa  204  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.792279  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1140  ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.083935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1759  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.88 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1698  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  46.4 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0060  ABC transporter related  47.71 
 
 		 231 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1393  ABC thiamine transporter, ATPase subunit  47.25 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2800  ABC transporter related  47.47 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.43358  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4268  thiamine ABC transporter ATP-binding protein  46.73 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1198  ABC transporter related  46.15 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.61 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 378 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.53 
 
 		 378 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6112  ABC transporter related  37.61 
 
 		 368 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  44.06 
 
 		 357 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 		 378 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 		 378 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 		 378 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 		 378 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.2 
 
 		 378 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 		 378 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 		 378 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 		 378 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 		 378 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.61 
 
 		 378 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3008  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 378 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3470  ABC transporter related  43.78 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 368 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  39.72 
 
 		 352 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  42.06 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.65 
 
 		 359 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.94 
 
 		 390 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  39.71 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.08 
 
 		 372 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 386 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  41.59 
 
 		 347 aa  151  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  41.59 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5239  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.57 
 
 		 377 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  39.15 
 
 		 338 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 377 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 		 380 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.43 
 
 		 380 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.43 
 
 		 380 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.54 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 		 357 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.3 
 
 		 360 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.45 
 
 		 352 aa  148  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  41.03 
 
 		 366 aa  148  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.43 
 
 		 378 aa  148  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.3 
 
 		 384 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  40.59 
 
 		 308 aa  148  7e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 375 aa  148  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2120  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 380 aa  148  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674614  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.89 
 
 		 353 aa  148  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.21 
 
 		 354 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2481  ABC transporter related  37.79 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869915  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  36.32 
 
 		 348 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  37.95 
 
 		 368 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  36.02 
 
 		 379 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 		 380 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 		 355 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.52 
 
 		 354 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 340 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  36.55 
 
 		 342 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1381  ABC transporter related  43.5 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.044144  normal  0.0317501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  38.16 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>