More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3470 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3470  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0621  thiamine transporter ATP-binding subunit  45.22 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0582  thiamine transporter ATP-binding subunit  44.74 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  47.17 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  46.7 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 246 aa  174  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.525623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  40.43 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1011  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1140  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.083935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1759  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.92 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1698  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  44.34 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  40.19 
 
 		 234 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  42.27 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  43.9 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  43.9 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.051764 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.6 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  41.55 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  43.35 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  48.04 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  43.35 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  43.35 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.04 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.04 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.04 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4268  thiamine ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00790  hypothetical protein  40.98 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  48.04 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2816  ABC transporter related  42.16 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.792279  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0060  ABC transporter related  45.81 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.29 
 
 		 377 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 		 378 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 		 378 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  38.57 
 
 		 363 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 		 378 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.32 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.75 
 
 		 367 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.29 
 
 		 400 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  42.11 
 
 		 371 aa  148  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  45.56 
 
 		 359 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.83 
 
 		 375 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.39 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3008  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.25 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.96 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  44.81 
 
 		 329 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1393  ABC thiamine transporter, ATPase subunit  45.32 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  41.43 
 
 		 328 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.25 
 
 		 378 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 		 382 aa  145  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.35 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.35 
 
 		 380 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.86 
 
 		 373 aa  144  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  41.71 
 
 		 378 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.44 
 
 		 378 aa  145  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 377 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 		 386 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 381 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 377 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  37.89 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.89 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.58 
 
 		 372 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.09 
 
 		 382 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  38.33 
 
 		 339 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  37.89 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.02 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  41.78 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 		 381 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 381 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  41.49 
 
 		 383 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  44.26 
 
 		 329 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 377 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.22 
 
 		 381 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>