More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3224 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  100 
 
 		 224 aa  438  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  57.69 
 
 		 227 aa  232  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  54.03 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  58.17 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  52.17 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  54.31 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  54.37 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  53.88 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.85 
 
 		 212 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  50.26 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  47.98 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  47.98 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  47.98 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  57.29 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  57.38 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  45.89 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  46.97 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  45.41 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  46.28 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  40.89 
 
 		 342 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.35 
 
 		 363 aa  148  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.07 
 
 		 327 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.27 
 
 		 378 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 352 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  42.79 
 
 		 346 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  35.92 
 
 		 329 aa  145  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  40.91 
 
 		 359 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  39.65 
 
 		 342 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.42 
 
 		 327 aa  144  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 355 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  41.87 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  42.51 
 
 		 341 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  42.56 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  38.92 
 
 		 331 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  38.92 
 
 		 331 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  47.25 
 
 		 363 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  42.03 
 
 		 364 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  42.71 
 
 		 383 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  47.59 
 
 		 348 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.99 
 
 		 359 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  37.76 
 
 		 356 aa  143  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  40.44 
 
 		 355 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 349 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  40.43 
 
 		 347 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  40.2 
 
 		 360 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  42.05 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  42.05 
 
 		 349 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  37.68 
 
 		 353 aa  141  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  47.28 
 
 		 373 aa  141  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  39.29 
 
 		 355 aa  141  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 347 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  40 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.58 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.76 
 
 		 346 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.58 
 
 		 349 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  41.05 
 
 		 349 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  39.91 
 
 		 355 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  43.68 
 
 		 362 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  39.91 
 
 		 355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  38.43 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  39.91 
 
 		 355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  41.8 
 
 		 366 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  40.09 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  44.15 
 
 		 362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  37.61 
 
 		 352 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  39.46 
 
 		 355 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  40.76 
 
 		 352 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 		 356 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.12 
 
 		 355 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  39.91 
 
 		 355 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.11 
 
 		 364 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  39.46 
 
 		 355 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  44.74 
 
 		 352 aa  138  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.72 
 
 		 372 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  39.91 
 
 		 355 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  43.55 
 
 		 356 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 		 350 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  41.09 
 
 		 329 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  43.43 
 
 		 347 aa  138  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  40.96 
 
 		 364 aa  138  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  40.62 
 
 		 358 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  42.05 
 
 		 343 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  42.55 
 
 		 372 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>