More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4044 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  100 
 
 		 213 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  65.22 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  58.17 
 
 		 224 aa  228  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  57.36 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  52.43 
 
 		 226 aa  211  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  58.25 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  57.77 
 
 		 214 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  51.79 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  57.81 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  52.36 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  47.12 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  46.63 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  54.4 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  48.66 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  46.07 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  48.13 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  48.13 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  48.13 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  47.59 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  47.59 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.13 
 
 		 366 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.9 
 
 		 358 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  43.02 
 
 		 356 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.89 
 
 		 343 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.88 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  42.65 
 
 		 353 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  44.72 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.96 
 
 		 377 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.81 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.15 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3834  ABC transporter related  42.57 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 		 343 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  41.54 
 
 		 329 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4066  ABC transporter related  45.14 
 
 		 379 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549495  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0593  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 360 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  44.67 
 
 		 372 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  45.6 
 
 		 353 aa  148  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  43.81 
 
 		 353 aa  148  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.77 
 
 		 369 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2987  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.49 
 
 		 366 aa  148  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238574  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.3 
 
 		 369 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.78 
 
 		 368 aa  147  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  44.16 
 
 		 359 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 		 372 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  41.03 
 
 		 329 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  44.33 
 
 		 353 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  43.96 
 
 		 356 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 		 374 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  42.36 
 
 		 353 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2631  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.33 
 
 		 358 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.56 
 
 		 357 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0570  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.97 
 
 		 365 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  42.05 
 
 		 373 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 		 378 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 		 346 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.93 
 
 		 378 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 		 378 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 		 378 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3244  ABC transporter related  43.98 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 		 378 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.97 
 
 		 364 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.3 
 
 		 378 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4045  ABC transporter related  41.84 
 
 		 367 aa  145  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.46 
 
 		 345 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  42.41 
 
 		 353 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 		 378 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3008  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.27 
 
 		 378 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4040  ABC transporter related  41.09 
 
 		 365 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.93 
 
 		 387 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2048  ABC transporter component  44.39 
 
 		 363 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 		 378 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 		 378 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 		 378 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 		 378 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.28 
 
 		 387 aa  144  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.49 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 380 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.15 
 
 		 359 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.93 
 
 		 361 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  41.62 
 
 		 364 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2834  ABC transporter related  39.59 
 
 		 358 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.698538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 374 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.88 
 
 		 374 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1266  ABC transporter related  40.31 
 
 		 365 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358849  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.6 
 
 		 359 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0754  ABC transporter related  47.28 
 
 		 363 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 		 338 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.61 
 
 		 355 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 		 374 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  43.65 
 
 		 362 aa  142  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2127  ABC transporter related  43.43 
 
 		 337 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0500595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>