More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3244 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3244  ABC transporter related  100 
 
 
214 aa  426  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31190  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  51.17 
 
 
348 aa  197  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264527  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  48.57 
 
 
363 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  47.6 
 
 
359 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  42.65 
 
 
350 aa  191  7e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  52 
 
 
346 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  52 
 
 
346 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  52 
 
 
346 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  50.48 
 
 
357 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  49.01 
 
 
371 aa  188  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.71 
 
 
351 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  45.71 
 
 
346 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  45.93 
 
 
349 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  47.34 
 
 
363 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  46.73 
 
 
387 aa  186  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  45.71 
 
 
346 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  42.11 
 
 
333 aa  186  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  46.67 
 
 
341 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2481  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
325 aa  185  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  51.2 
 
 
360 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  47 
 
 
376 aa  184  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.78 
 
 
373 aa  184  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  47.34 
 
 
363 aa  184  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.55 
 
 
366 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  47.42 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  47.85 
 
 
362 aa  183  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.54 
 
 
352 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 
377 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 
377 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  44.98 
 
 
328 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 
377 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  46.89 
 
 
328 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  44.5 
 
 
356 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
378 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 
378 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.27 
 
 
360 aa  182  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.03 
 
 
360 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 
380 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.78 
 
 
378 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.27 
 
 
378 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.28 
 
 
380 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.06 
 
 
386 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5239  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 
380 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 
388 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.06 
 
 
386 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.28 
 
 
388 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.06 
 
 
386 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 
388 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.78 
 
 
377 aa  181  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 
363 aa  181  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  38.86 
 
 
323 aa  181  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0375  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
316 aa  181  8.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  44.5 
 
 
329 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  45.89 
 
 
347 aa  181  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.61 
 
 
384 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  40.3 
 
 
323 aa  180  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.78 
 
 
380 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.77 
 
 
372 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  48.02 
 
 
378 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.28 
 
 
377 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.58 
 
 
386 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  48.8 
 
 
348 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.24 
 
 
336 aa  180  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  46.67 
 
 
346 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.78 
 
 
380 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
384 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 
386 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  41.63 
 
 
339 aa  180  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  45.19 
 
 
344 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.27 
 
 
363 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.52 
 
 
327 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  44.76 
 
 
342 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.28 
 
 
387 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 
386 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45 
 
 
329 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  45.05 
 
 
333 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 
423 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
378 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
333 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 
378 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 
384 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  50 
 
 
342 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
384 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 
384 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 
372 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  46.23 
 
 
350 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  44.98 
 
 
341 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  45.93 
 
 
399 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 
327 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
378 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 
331 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 
331 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.58 
 
 
387 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.63 
 
 
384 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.58 
 
 
390 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 
327 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.24 
 
 
399 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  46.63 
 
 
350 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 
327 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 
377 aa  178  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>