More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15311 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_15311  ABC transporter for sugars, ATP binding protein  100 
 
 
322 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1424  ATPase  61.06 
 
 
330 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0734659 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  61.06 
 
 
324 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0947  ATPase  47.15 
 
 
355 aa  292  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  40.97 
 
 
353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  51.85 
 
 
369 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  43.21 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.3 
 
 
332 aa  272  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 
333 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  43.11 
 
 
333 aa  268  8e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  42.07 
 
 
362 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  41.62 
 
 
355 aa  268  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  44.79 
 
 
333 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  40.12 
 
 
359 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.72 
 
 
354 aa  267  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  43.16 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  41.91 
 
 
361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  41.6 
 
 
359 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0844  ABC transporter related protein  42.07 
 
 
362 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 
333 aa  265  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  44.44 
 
 
341 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  44.75 
 
 
333 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
375 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  42.33 
 
 
359 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  41 
 
 
361 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  43.25 
 
 
333 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  41.19 
 
 
357 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  42.59 
 
 
332 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  44.14 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  40 
 
 
363 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  43.93 
 
 
330 aa  261  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  46.88 
 
 
325 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  52.92 
 
 
359 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  49.04 
 
 
364 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  43.38 
 
 
336 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  41.08 
 
 
361 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  44 
 
 
333 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 
337 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  41.14 
 
 
357 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  43.07 
 
 
362 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  42.28 
 
 
332 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  52.48 
 
 
360 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  38.33 
 
 
363 aa  260  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  43.48 
 
 
325 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3385  ABC transporter related  42.82 
 
 
361 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.33 
 
 
357 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.33 
 
 
357 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  45.86 
 
 
336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  41.96 
 
 
359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.41 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  39.88 
 
 
351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  44.88 
 
 
358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.14 
 
 
362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  49.59 
 
 
371 aa  258  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  39.89 
 
 
363 aa  258  7e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  41.98 
 
 
349 aa  258  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.33 
 
 
357 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  43.79 
 
 
342 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  41.99 
 
 
335 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  40.23 
 
 
349 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  38.97 
 
 
375 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  39.6 
 
 
354 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.05 
 
 
357 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  44.65 
 
 
367 aa  257  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  39.89 
 
 
358 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  44.48 
 
 
332 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  38.72 
 
 
366 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 
366 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  43.65 
 
 
331 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  39.89 
 
 
356 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  42.39 
 
 
338 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  45.39 
 
 
365 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  42.64 
 
 
350 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  42.21 
 
 
371 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  43.34 
 
 
334 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  38.92 
 
 
369 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 
386 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  39.78 
 
 
370 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  42.2 
 
 
353 aa  256  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  52.7 
 
 
360 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  47.78 
 
 
349 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  40.86 
 
 
360 aa  255  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.88 
 
 
358 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  44.66 
 
 
364 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  42.35 
 
 
361 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  41.62 
 
 
335 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  38.75 
 
 
356 aa  255  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  47.74 
 
 
353 aa  255  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  49.58 
 
 
376 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  40.76 
 
 
340 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  40.23 
 
 
355 aa  254  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  44.14 
 
 
332 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  39.89 
 
 
358 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  41.45 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  44.87 
 
 
347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.89 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  40.58 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  42.81 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.82 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  42.64 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>