More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0947 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0947  ATPase  100 
 
 
355 aa  711    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
356 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  50.29 
 
 
365 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  47.65 
 
 
358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  48.9 
 
 
393 aa  307  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  46.36 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  48.19 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  47.58 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.59 
 
 
349 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 
349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 
376 aa  305  7e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  44.76 
 
 
374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  44.35 
 
 
375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  45.93 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  41.85 
 
 
372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  44.78 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.84 
 
 
369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 
365 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  46.09 
 
 
359 aa  302  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  45.69 
 
 
364 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1481  ABC transporter related  46.48 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00851578  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  43.79 
 
 
375 aa  301  8.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 
365 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  45.75 
 
 
399 aa  301  9e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  45.01 
 
 
378 aa  301  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  41.08 
 
 
370 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.9 
 
 
365 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  48.3 
 
 
370 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  46.18 
 
 
375 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  44.31 
 
 
381 aa  300  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  44.85 
 
 
362 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  42.28 
 
 
369 aa  300  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  46.31 
 
 
361 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  44.99 
 
 
368 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  45.14 
 
 
371 aa  299  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  45.03 
 
 
379 aa  299  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
416 aa  299  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  46.5 
 
 
360 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  43.61 
 
 
363 aa  299  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  45.51 
 
 
363 aa  299  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.04 
 
 
351 aa  298  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  43.63 
 
 
392 aa  298  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  45.68 
 
 
361 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  46.5 
 
 
360 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 
351 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  46.18 
 
 
366 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  42.03 
 
 
371 aa  297  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.9 
 
 
367 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  45.06 
 
 
364 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
378 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
349 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  50.34 
 
 
363 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 
363 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
349 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
370 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  43.15 
 
 
368 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 
369 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  45 
 
 
361 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  47.66 
 
 
380 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  44.25 
 
 
360 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  43.84 
 
 
369 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  46.05 
 
 
356 aa  296  4e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  45.99 
 
 
402 aa  295  6e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  45.22 
 
 
362 aa  295  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  45.92 
 
 
357 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  42.78 
 
 
381 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
374 aa  295  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0844  ABC transporter related protein  45.22 
 
 
362 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  43.58 
 
 
349 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  41.48 
 
 
370 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.31 
 
 
351 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.98 
 
 
355 aa  294  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  48.18 
 
 
363 aa  293  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  43.94 
 
 
367 aa  294  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  43.94 
 
 
367 aa  294  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1944  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  50.71 
 
 
356 aa  293  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  43.17 
 
 
386 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  43.91 
 
 
385 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  42.78 
 
 
379 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  51.05 
 
 
360 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.69 
 
 
355 aa  293  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
364 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  46.01 
 
 
384 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
364 aa  292  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  45.04 
 
 
359 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  47.42 
 
 
365 aa  292  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  47.28 
 
 
359 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
364 aa  292  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  44.96 
 
 
365 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  43.17 
 
 
365 aa  292  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15311  ABC transporter for sugars, ATP binding protein  47.15 
 
 
322 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.26 
 
 
366 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  47.88 
 
 
373 aa  291  9e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  42.2 
 
 
380 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  46.65 
 
 
410 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  41.23 
 
 
360 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3269  ABC transporter related  47.16 
 
 
361 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>