207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2481 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  76.22 
 
 		 164 aa  257  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  65.64 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  60.84 
 
 		 174 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  57.06 
 
 		 163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  55.7 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  57.79 
 
 		 162 aa  180  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  62.68 
 
 		 153 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  60.27 
 
 		 153 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  55.7 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  58.22 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  56.16 
 
 		 153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  57.25 
 
 		 153 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  55.94 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  47.65 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  48.28 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  47.02 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  48.61 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  46.21 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  43.67 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  47.26 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  41.26 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  45.76 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  40.68 
 
 		 151 aa  97.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  39.34 
 
 		 145 aa  97.4  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  44.63 
 
 		 143 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  44.63 
 
 		 143 aa  96.7  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.36 
 
 		 138 aa  88.2  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  36.13 
 
 		 135 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  35.92 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  40.77 
 
 		 385 aa  84.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  41.18 
 
 		 131 aa  84.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  37.6 
 
 		 167 aa  84.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  36.29 
 
 		 332 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  39.16 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  39.1 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  38.76 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  40.71 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  40.83 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  38.52 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  31.58 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  36.29 
 
 		 324 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.97 
 
 		 311 aa  77.4  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  34.88 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  38.21 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  39.26 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  43.3 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  39.68 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  41.05 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  35.19 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  39.37 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  35 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  35.42 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  37.98 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  35.42 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  35.42 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  34.26 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  40.18 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  35.42 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  35.42 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  32.21 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  34.81 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  36.43 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  37.68 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  38.1 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  34.38 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  34.38 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  37.32 
 
 		 241 aa  72  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  35.77 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  43.62 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36.03 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  33.64 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  34.65 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  36.92 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  35.83 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  34.38 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  32.29 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  34.59 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  30.48 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  39.05 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  34.06 
 
 		 232 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  37.04 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  41 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  34.53 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  37.4 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  30.48 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  36.89 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  35.77 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  32.99 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  39.58 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  38.71 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  32.62 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  35.42 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  33.86 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  35.96 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  35.25 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  36.07 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  35.42 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>