More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0066 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  100 
 
 		 618 aa  1281    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  51.81 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  48.53 
 
 		 591 aa  608  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  49.91 
 
 		 660 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  48.91 
 
 		 660 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  48.66 
 
 		 660 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  49.3 
 
 		 655 aa  584  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  48.11 
 
 		 656 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  47.29 
 
 		 660 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  47.92 
 
 		 602 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  47.93 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  48.1 
 
 		 612 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  48.62 
 
 		 612 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  48.17 
 
 		 611 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  47.99 
 
 		 613 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  48.02 
 
 		 660 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  47.99 
 
 		 611 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  48.51 
 
 		 611 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  48.01 
 
 		 603 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  48.33 
 
 		 611 aa  561  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  44.61 
 
 		 593 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  47.4 
 
 		 658 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  46.39 
 
 		 612 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  44.79 
 
 		 656 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  46.55 
 
 		 626 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  46.48 
 
 		 621 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  46.6 
 
 		 619 aa  549  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  46.46 
 
 		 622 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  44.03 
 
 		 631 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  47.27 
 
 		 626 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  46.26 
 
 		 626 aa  545  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  46.86 
 
 		 643 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  46.38 
 
 		 626 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  45.38 
 
 		 660 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  46.06 
 
 		 629 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  46.09 
 
 		 625 aa  528  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  44.5 
 
 		 634 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  44.58 
 
 		 630 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  46.17 
 
 		 632 aa  518  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  44.97 
 
 		 630 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  43.83 
 
 		 629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  44.97 
 
 		 630 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  44.83 
 
 		 629 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  44.79 
 
 		 630 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  44.64 
 
 		 626 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  44.87 
 
 		 632 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  45.57 
 
 		 625 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  44.23 
 
 		 629 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  44.87 
 
 		 632 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  44.23 
 
 		 629 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  44.87 
 
 		 632 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  44 
 
 		 630 aa  515  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  44 
 
 		 629 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  44.21 
 
 		 629 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  44.85 
 
 		 625 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  44.21 
 
 		 629 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  44.87 
 
 		 626 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  44.48 
 
 		 630 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  44.93 
 
 		 629 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  43.01 
 
 		 629 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  43.38 
 
 		 661 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  43.38 
 
 		 661 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  47.54 
 
 		 487 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  38.38 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  34.12 
 
 		 557 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  29.64 
 
 		 566 aa  257  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  29.45 
 
 		 566 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  29.27 
 
 		 566 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  29.09 
 
 		 566 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  29.09 
 
 		 566 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.06 
 
 		 546 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  26.73 
 
 		 549 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.67 
 
 		 557 aa  184  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  25.14 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.67 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.56 
 
 		 539 aa  164  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.41 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  26.9 
 
 		 553 aa  156  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  25.86 
 
 		 583 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  26.85 
 
 		 596 aa  151  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 550 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.55 
 
 		 560 aa  150  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.17 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  24.43 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.64 
 
 		 544 aa  139  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.43 
 
 		 557 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  24.87 
 
 		 535 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  23.05 
 
 		 564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  25.22 
 
 		 543 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  25 
 
 		 541 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  23.2 
 
 		 532 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  25.72 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  25.52 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4333  putative metallo-dependent hydrolase  25.3 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  25.85 
 
 		 541 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  26.04 
 
 		 563 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  25.71 
 
 		 583 aa  124  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  23.3 
 
 		 522 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  24.83 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>