184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1054 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  259  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  56.19 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  49.51 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  43.81 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2492  putative transcriptional regulator  43.01 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3145  putative transcriptional regulator  43.01 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1388  putative transcriptional regulator  44.57 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.682529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2054  putative transcriptional regulator  42 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.295818  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5059  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  44.32 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  43.18 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1972  putative transcriptional regulator  43.43 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000001755  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3120  putative transcriptional regulator  42.05 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0075021  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3220  putative transcriptional regulator  42.7 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00911883  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1528  putative transcriptional regulator  43.9 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1070  helix-turn-helix HxlR type  30 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000989417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  32.58 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  30.34 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  28.45 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  31.82 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 246 aa  50.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  26.09 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  33.7 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  29 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  31.58 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  32.95 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0198  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  35.8 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  32.22 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  31.11 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0377  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0395493  normal  0.03196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0609  transcriptional regulator, HxlR family  32.22 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.822325  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  31.96 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  32.94 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  25.74 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0265  HxlR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00635025  normal  0.325102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 228 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  31.82 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  31.87 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1397  transcriptional regulator, HxlR family  28.45 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  29.67 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  27 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  24.18 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  30.39 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1133  transcriptional regulator, HxlR family  30.43 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0758  transcriptional regulator, HxlR family  29.21 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  30.21 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  31.11 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  30.3 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  29.55 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  28.71 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  34.12 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  27.08 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  34.15 
 
 		 218 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0070  hypothetical protein  28.89 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0977  HxlR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.363566  normal  0.0295243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  28.87 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  25 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3142  helix-turn-helix, HxlR type  27.78 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.933421  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  29.03 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1090  HxlR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  30.85 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  22.22 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>