More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0198 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0198  transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0377  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0395493  normal  0.03196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2189  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3139  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.31 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  35.65 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  41.94 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  39.18 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  34.29 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  42 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  47.83 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  39.8 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  37.38 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2599  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1133  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  39.33 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  43.18 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  38.32 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  43.62 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  43.02 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  31.43 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  38 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3340  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  37.19 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  38.64 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  43.9 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  34.41 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  42.7 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  38.89 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0045  hypothetical protein  49.23 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  53.33 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  41.77 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  38.18 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  42.53 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  38.64 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  38.64 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  38.64 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  36.54 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  41.38 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  41.38 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  41.38 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  41.38 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  41.38 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  41.38 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>