More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3139 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3139  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 117 aa  235  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1278  HxlR family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.592235 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0377  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0395493  normal  0.03196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0198  transcriptional regulator  42.16 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2392  transcriptional regulator  41.77 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.724606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6398  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6229  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6631  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.932723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2189  HxlR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2599  HxlR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  36.17 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  36.17 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  36.17 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  38.2 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  36.17 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  40.45 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  36.17 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  35.79 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3472  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4158  HxlR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  37.08 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0928  hypothetical protein  41.94 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  34.09 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  34.88 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  40.66 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4770  HxlR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0843  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3397  HxlR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4119  HxlR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  39.53 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40.51 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0977  HxlR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.363566  normal  0.0295243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  33 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  35.42 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  35.42 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  34.09 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  35.48 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0738  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.254703  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0045  hypothetical protein  41.43 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  34.29 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  33.71 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  32.18 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0720  cinnamoyl ester hydrolase  37.04 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  32.99 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  41.56 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  31.87 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  37.08 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  31.11 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  34.12 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  29.67 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>