More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0045 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2599  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2189  HxlR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3367  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0198  transcriptional regulator  49.23 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0377  transcriptional regulator, HxlR family  49.23 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0395493  normal  0.03196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  42.05 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  40.22 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  42.5 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  41.98 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  45.33 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  43.59 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3340  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  40.7 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  37.76 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4674  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.591353 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  37.76 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  38.75 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  38.55 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  42.67 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  42.67 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  42.67 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  42.67 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1278  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.592235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  35.45 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  36.54 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  43.04 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  37.33 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  40.45 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  37.97 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  37.65 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3451  transcriptional regulator, HxlR family  36.05 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  36.96 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  38.82 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25580  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  37.65 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  38.82 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  41.33 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  43.04 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  36.05 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  38.27 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  35.19 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  38.96 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  40.24 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  40.28 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  41.56 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  35.79 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  39.08 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>