More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0511 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  100 
 
 
238 aa  479  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  44.4 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  43.98 
 
 
253 aa  207  8e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  42.37 
 
 
244 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 
239 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  44.68 
 
 
244 aa  204  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
244 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
241 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  42.8 
 
 
244 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  43.1 
 
 
242 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  41.95 
 
 
244 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  44.78 
 
 
243 aa  202  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  42.8 
 
 
244 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  45.11 
 
 
241 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  42.98 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  45.38 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  44.54 
 
 
249 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  42.55 
 
 
245 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  41.28 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  43.46 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  42.26 
 
 
245 aa  195  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  41.27 
 
 
264 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  41.04 
 
 
280 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  42.68 
 
 
239 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  43.4 
 
 
245 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  43.46 
 
 
245 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  39.75 
 
 
247 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.28 
 
 
239 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  42.23 
 
 
283 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.87 
 
 
265 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  43.28 
 
 
239 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  43.28 
 
 
239 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  40.43 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  39.92 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  44.9 
 
 
603 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  44.77 
 
 
242 aa  187  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  40.64 
 
 
252 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  41.18 
 
 
240 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  41.28 
 
 
242 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  41.46 
 
 
268 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
255 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 
239 aa  185  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  41.83 
 
 
293 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  43.1 
 
 
242 aa  184  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  43.22 
 
 
241 aa  185  7e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.44 
 
 
609 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  40.64 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  40.96 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  40.64 
 
 
275 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  40.64 
 
 
275 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  40.17 
 
 
616 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  40.74 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  38.89 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  43.1 
 
 
242 aa  181  6e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  42.51 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  40.24 
 
 
333 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  39.04 
 
 
259 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  39.53 
 
 
259 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  40.51 
 
 
253 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  39.5 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  39.36 
 
 
274 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  37.2 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  40.64 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  39.43 
 
 
271 aa  178  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  40 
 
 
255 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  40.16 
 
 
273 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  42.74 
 
 
286 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  39.52 
 
 
261 aa  177  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.7 
 
 
258 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  37.65 
 
 
250 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  38.24 
 
 
243 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  40.32 
 
 
261 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  40.24 
 
 
261 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  41.7 
 
 
258 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  41.32 
 
 
269 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  41.7 
 
 
258 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
276 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  41.7 
 
 
258 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  38.74 
 
 
255 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  41.7 
 
 
258 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  37.7 
 
 
255 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  37.9 
 
 
254 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  38.4 
 
 
253 aa  175  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  38.3 
 
 
244 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 
256 aa  175  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  38.15 
 
 
260 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
273 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  38.34 
 
 
255 aa  175  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  39.53 
 
 
254 aa  175  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  38.98 
 
 
273 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  39.13 
 
 
282 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.24 
 
 
241 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  39.13 
 
 
275 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4800  ABC transporter related  36.86 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.773333  normal  0.195705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  38.1 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2586  ABC transporter related  39.66 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  40.49 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  40.49 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  39.37 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>