More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4509 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  100 
 
 		 338 aa  677    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  53.75 
 
 		 321 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  51.57 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  55.78 
 
 		 301 aa  315  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  50.15 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  49.07 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  50.5 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  49.01 
 
 		 320 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  37.58 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  37.11 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  33.96 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  36.86 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  33.64 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  32.62 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  33.85 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  35.62 
 
 		 318 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  33.12 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  37.38 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  33.01 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  35.58 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.38 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.72 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  32.8 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  32.31 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  32.47 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  34.45 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  31.79 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.21 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  34.83 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.45 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  38.94 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  31.31 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  34.16 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  28.2 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  33.33 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  31.96 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  29.17 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  37.25 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  30.77 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  32.21 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  30.91 
 
 		 329 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  33.62 
 
 		 375 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  30.87 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  32.53 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  35.76 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  34.48 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  35.21 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  29.49 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  38.71 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  35.71 
 
 		 374 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  33.02 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  29.28 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  33.9 
 
 		 307 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  30.34 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  30.14 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.62 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  31.94 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  33.92 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  35.71 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  34.78 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  30.66 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  31.69 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  31.5 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.7 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  34.78 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1630  putative FecR  30.56 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  31.63 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  27.38 
 
 		 368 aa  105  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  32.51 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  34.27 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  30.6 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  30.74 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  31.54 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.68 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.62 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  30.03 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  32.34 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  29.97 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  31.07 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  33.8 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  28.85 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  30.13 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  32.15 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  31.63 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  35.12 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  33.13 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  30.59 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  25.72 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  37.62 
 
 		 444 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  31.33 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>