More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3450 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 		 330 aa  681    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  38.26 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  36.31 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  36.36 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  36.96 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  35.15 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  33.97 
 
 		 348 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  34.38 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  34.09 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  34.04 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  35.16 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  34.18 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  33.15 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  35.37 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  38.19 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  34.11 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  33.52 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  35.25 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  35.63 
 
 		 338 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  34.31 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  35.57 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  33.06 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  34.07 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  35.74 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  33.71 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  37.61 
 
 		 346 aa  112  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  34.25 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  34.37 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  33.06 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  34.47 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  35.19 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  33.72 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  33.7 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  42.86 
 
 		 245 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  34.54 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  32.97 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  32.22 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  32.76 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  31.77 
 
 		 359 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  34.29 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  40.61 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  32.64 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  39.83 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  34.57 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  39.53 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  32.88 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  31.75 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  29.41 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  29.55 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  32.35 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  32.38 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  30.85 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  39.66 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  34.82 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  30.46 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  30.69 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  30.26 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  26.2 
 
 		 259 aa  93.2  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  29.72 
 
 		 309 aa  89.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  28.27 
 
 		 326 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  37.73 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  34.52 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  49.24 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  83.33 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  25.43 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  26.54 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  53.73 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  41.04 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  32.82 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  30.97 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  27.84 
 
 		 768 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  43.08 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  48.21 
 
 		 142 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  46.43 
 
 		 142 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  39.44 
 
 		 152 aa  54.3  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  42.42 
 
 		 140 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 		 124 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  46.43 
 
 		 173 aa  53.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  35.14 
 
 		 99 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.84 
 
 		 171 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  41.27 
 
 		 162 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  34.92 
 
 		 122 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 		 144 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  31.75 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  28.28 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  39.06 
 
 		 128 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4143  comG operon protein 3  33.78 
 
 		 99 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3983  comG operon protein 3  33.78 
 
 		 99 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0155019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  36.36 
 
 		 129 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 164 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4464  ComG operon protein 3  33.78 
 
 		 99 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  38.1 
 
 		 131 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  38.1 
 
 		 131 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  39.68 
 
 		 131 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 148 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0958  hypothetical protein  33.01 
 
 		 742 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  39.06 
 
 		 124 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>