More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1379 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1379  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 495 aa  988    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  39.53 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  36.54 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  34.62 
 
 		 502 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.85 
 
 		 513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  36.79 
 
 		 472 aa  213  7e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  37.09 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  39.58 
 
 		 471 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  34.95 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  34.95 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  35.94 
 
 		 449 aa  209  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  35.2 
 
 		 499 aa  209  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  34.95 
 
 		 450 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  34.95 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.86 
 
 		 500 aa  208  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  37.35 
 
 		 508 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  35.52 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  41.32 
 
 		 497 aa  207  3e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  38.72 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  36.18 
 
 		 455 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  38.72 
 
 		 481 aa  207  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  36.91 
 
 		 456 aa  206  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  34.23 
 
 		 451 aa  206  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  35.19 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  38.73 
 
 		 450 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  38.73 
 
 		 450 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  38.73 
 
 		 450 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  39.04 
 
 		 501 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  36.89 
 
 		 469 aa  205  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  36.36 
 
 		 500 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  36.13 
 
 		 496 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  38.13 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  35.1 
 
 		 456 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  38.8 
 
 		 456 aa  204  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  41.78 
 
 		 450 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  36.66 
 
 		 524 aa  203  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  41.58 
 
 		 481 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  41.87 
 
 		 481 aa  203  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  35.1 
 
 		 528 aa  203  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  35.77 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  36.66 
 
 		 524 aa  203  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  38.44 
 
 		 450 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  40.24 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  36.34 
 
 		 451 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  34.79 
 
 		 459 aa  202  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  37.5 
 
 		 456 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  33.69 
 
 		 479 aa  202  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  40.68 
 
 		 457 aa  202  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  35.08 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  35.08 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  34.62 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  37.1 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  39.3 
 
 		 446 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  35.08 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  33.56 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  35.08 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  38.18 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  36.75 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  39.79 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  37.89 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  35.08 
 
 		 474 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  35.08 
 
 		 474 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  34.3 
 
 		 498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  38.68 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  34.53 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  35.08 
 
 		 474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  35.87 
 
 		 501 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  38.08 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  37.53 
 
 		 463 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  41.61 
 
 		 460 aa  200  6e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  34.82 
 
 		 474 aa  199  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  36.89 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  36.83 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  38.08 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  35.92 
 
 		 462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  38.74 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  38.75 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  36.89 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  36.27 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  38.38 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  36.53 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  35.84 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  35.95 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  32.39 
 
 		 504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  39.3 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  35.1 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  35.84 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  38.07 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  35.84 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  35.84 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  37.53 
 
 		 523 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  35.84 
 
 		 455 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  39.82 
 
 		 535 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  41.87 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  38.75 
 
 		 497 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  32.89 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  35.48 
 
 		 481 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.34 
 
 		 465 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  41.87 
 
 		 402 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  34.03 
 
 		 475 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>