More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0316 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  85.9 
 
 
463 aa  675    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
392 aa  795    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  63.94 
 
 
482 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0825  extracellular ligand-binding receptor  65.9 
 
 
392 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 
425 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 
447 aa  186  9e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  34.53 
 
 
451 aa  169  8e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 
427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  30.22 
 
 
826 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  32.69 
 
 
433 aa  157  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
416 aa  157  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 
426 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 
824 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
435 aa  152  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 
449 aa  150  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
752 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2043  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000117628  normal  0.0195109 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  30.46 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.65 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.73 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  22.51 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  29.69 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4482  extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 
371 aa  67  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  25.69 
 
 
405 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  24.51 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 
394 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.61 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.08 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.08 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.08 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.08 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.88 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.93 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  26.34 
 
 
382 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  24.08 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.08 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.19 
 
 
449 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.08 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 
442 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.08 
 
 
380 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 
377 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  24.08 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.19 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  25.16 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  23.8 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.04 
 
 
446 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  21.52 
 
 
388 aa  59.7  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  22.51 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.46 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.15 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  23.67 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.23 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  25.4 
 
 
421 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  32.28 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
449 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  23.51 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  26.8 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.05 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  23.51 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  23.51 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  26.46 
 
 
368 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  22.86 
 
 
374 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  26.46 
 
 
368 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.8 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.8 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.8 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.8 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  26.8 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
426 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 
373 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>