More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1073 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  100 
 
 		 384 aa  782    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  61.14 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  56.71 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  55.67 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  46.91 
 
 		 402 aa  323  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  49.15 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  39.22 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  43.52 
 
 		 373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  40.52 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  40.51 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  39.6 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  40.31 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  38.22 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  37.44 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  39.37 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  38.27 
 
 		 378 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  37.27 
 
 		 378 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  37.18 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  38.86 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  35.79 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  39.12 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  39.35 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  45.99 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  39.43 
 
 		 392 aa  229  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  38.27 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  36.45 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  38.01 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  35.37 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  46.15 
 
 		 273 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  36.27 
 
 		 383 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  37.06 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  36.71 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  36.21 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  35.43 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  40.99 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  34.16 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  35.14 
 
 		 386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  33.93 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  34.41 
 
 		 397 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  39.24 
 
 		 408 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  35.59 
 
 		 424 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  33.17 
 
 		 413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  40.57 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  36.84 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  41.11 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  32.83 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  39.66 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  36.68 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  35.14 
 
 		 412 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  32.57 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  40.73 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  30.69 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  36.57 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  40.08 
 
 		 389 aa  179  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  37.32 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  35.53 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  36.94 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  39.34 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  30.15 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  31.54 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  32.99 
 
 		 386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  32.76 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  30.29 
 
 		 371 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  35.91 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  33.67 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 379 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  29.21 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  29.61 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  31.73 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  29.86 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  28.09 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  33.85 
 
 		 374 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  34.6 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  32.84 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  30.2 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  31.42 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  35.44 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  33.17 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  31.4 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  27.96 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  28.25 
 
 		 361 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  31.68 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  32.32 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  31.88 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  31.4 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  22.13 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  30.61 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  28.5 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 330 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  30.43 
 
 		 282 aa  99.8  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  28 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1422  anti-FecI sigma factor, FecR  21.49 
 
 		 328 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  normal  0.0205003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>