More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1015 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  100 
 
 		 488 aa  1019    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4130  outer membrane efflux protein  60.55 
 
 		 516 aa  588  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  49.89 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  37.72 
 
 		 525 aa  295  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.24 
 
 		 491 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  24.17 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  22.82 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 420 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 		 464 aa  90.5  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.31 
 
 		 463 aa  89.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  20.9 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  20.9 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  20.9 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  20.9 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.22 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  21.46 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  20.14 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.46 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.23 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  20.43 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  20.51 
 
 		 517 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  20.13 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  20 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  19.56 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.44 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  19.87 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  21.84 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  20.29 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  20.81 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  20.14 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  23.97 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  19.87 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  20.22 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.32 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 535 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  20.77 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1470 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.44 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.27 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  18.98 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 1496 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.82 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  20.52 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  18.12 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  24.57 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  24.16 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.09 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.17 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.17 
 
 		 519 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.08 
 
 		 477 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  21.64 
 
 		 451 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.99 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  25.41 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  23.44 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1499  outer membrane efflux protein OprB  24.18 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.28 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0060  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.28 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0428433  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  24.28 
 
 		 553 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.08 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.28 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.28 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  24.28 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.87 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.28 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  24.28 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.83 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>