More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0638 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  86.01 
 
 		 589 aa  1031    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  57.8 
 
 		 594 aa  684    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  87.39 
 
 		 592 aa  1047    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 592 aa  1171    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  83.45 
 
 		 588 aa  1016    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  50.51 
 
 		 601 aa  600  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  47.02 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  46.17 
 
 		 597 aa  521  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  46.1 
 
 		 600 aa  511  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  43.41 
 
 		 598 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  43.24 
 
 		 598 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  44.48 
 
 		 602 aa  491  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  43.84 
 
 		 598 aa  486  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  46.13 
 
 		 593 aa  488  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  43.24 
 
 		 598 aa  485  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  43.49 
 
 		 591 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  44.26 
 
 		 598 aa  480  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  41.89 
 
 		 591 aa  478  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  42.01 
 
 		 593 aa  477  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  43.19 
 
 		 589 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  42.4 
 
 		 604 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  42.23 
 
 		 591 aa  456  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  42.88 
 
 		 597 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  40.75 
 
 		 593 aa  443  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  41.46 
 
 		 599 aa  439  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  40.54 
 
 		 607 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  41.53 
 
 		 604 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  41.29 
 
 		 602 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  36.93 
 
 		 623 aa  361  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  36.42 
 
 		 599 aa  356  5.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  35.57 
 
 		 1228 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  35.42 
 
 		 1072 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  34.58 
 
 		 997 aa  304  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  29.33 
 
 		 571 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  30.38 
 
 		 917 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  29.55 
 
 		 920 aa  153  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  31.49 
 
 		 888 aa  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33386  mitochondrial translation initiation factor 2  31.5 
 
 		 683 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  28.72 
 
 		 903 aa  148  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  32.07 
 
 		 970 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  26.69 
 
 		 887 aa  146  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  27.27 
 
 		 692 aa  146  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  29.4 
 
 		 903 aa  144  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  27.14 
 
 		 997 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  30.24 
 
 		 822 aa  143  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  28.32 
 
 		 658 aa  143  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  26.71 
 
 		 656 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  27.36 
 
 		 614 aa  142  9.999999999999999e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  26.7 
 
 		 882 aa  143  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 692 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  29.97 
 
 		 946 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  29.97 
 
 		 951 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  27.63 
 
 		 905 aa  141  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  28.35 
 
 		 876 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  29.22 
 
 		 966 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  26.48 
 
 		 690 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  31.56 
 
 		 950 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  28.01 
 
 		 685 aa  139  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  27.8 
 
 		 579 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  30.13 
 
 		 992 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  27.93 
 
 		 689 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  28.33 
 
 		 979 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05630  GTPase, putative  27.5 
 
 		 877 aa  137  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  26.68 
 
 		 693 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  28.11 
 
 		 686 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  28.11 
 
 		 686 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  28.22 
 
 		 854 aa  137  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 971 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  28.94 
 
 		 887 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  27.08 
 
 		 949 aa  137  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  28.35 
 
 		 838 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  28.28 
 
 		 968 aa  137  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  29.24 
 
 		 965 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  27.76 
 
 		 686 aa  137  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  27.76 
 
 		 686 aa  137  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 972 aa  137  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  29.85 
 
 		 885 aa  137  8e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  26.9 
 
 		 908 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  27.52 
 
 		 686 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  28.77 
 
 		 877 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  27.36 
 
 		 908 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  29.64 
 
 		 601 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  27.82 
 
 		 732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  27.42 
 
 		 686 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  27.18 
 
 		 688 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 975 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  27.42 
 
 		 686 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 976 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0563  translation initiation factor IF-2  27.43 
 
 		 830 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 975 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  28.33 
 
 		 971 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  27.63 
 
 		 1079 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  28.33 
 
 		 971 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 975 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 975 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  27.76 
 
 		 972 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  27.35 
 
 		 688 aa  135  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  28.33 
 
 		 971 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 975 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 975 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>