79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01675 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  100 
 
 		 342 aa  689    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  54.66 
 
 		 657 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  34.87 
 
 		 670 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  32.77 
 
 		 664 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  31.49 
 
 		 669 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  30.13 
 
 		 632 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  28.83 
 
 		 667 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  30.8 
 
 		 669 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  27.85 
 
 		 697 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  30.37 
 
 		 669 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  27.4 
 
 		 656 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  30.22 
 
 		 689 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  28 
 
 		 688 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  28.44 
 
 		 688 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  30.22 
 
 		 689 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  27.6 
 
 		 688 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  27.6 
 
 		 688 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  27.6 
 
 		 688 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  27.35 
 
 		 680 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  26 
 
 		 649 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  27.6 
 
 		 688 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  26.32 
 
 		 674 aa  76.3  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  27.19 
 
 		 691 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  29.17 
 
 		 762 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  25.78 
 
 		 677 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  25.82 
 
 		 765 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  24.77 
 
 		 678 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  25.21 
 
 		 735 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  25.22 
 
 		 686 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  26.23 
 
 		 765 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24 
 
 		 704 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  25.55 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  25.55 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  25.55 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  25.55 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  25.55 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  25.55 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  25.55 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  25.55 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  24.67 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  24.67 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  24.67 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  24.67 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  24.67 
 
 		 686 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  28.89 
 
 		 791 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  23.31 
 
 		 740 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  22.58 
 
 		 791 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  26.87 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  30.26 
 
 		 764 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  29.89 
 
 		 761 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  37.8 
 
 		 830 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  37.8 
 
 		 830 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  37.8 
 
 		 824 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  37.8 
 
 		 830 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  37.8 
 
 		 830 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  37.8 
 
 		 830 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  37.8 
 
 		 830 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  30 
 
 		 759 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  30.91 
 
 		 765 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  30.91 
 
 		 765 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  30.91 
 
 		 765 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  29.63 
 
 		 818 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  27.27 
 
 		 765 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  26.62 
 
 		 765 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 729 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  31.71 
 
 		 745 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  31.71 
 
 		 739 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  22.82 
 
 		 710 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  25.32 
 
 		 818 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  32.56 
 
 		 737 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  24.44 
 
 		 660 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  24.44 
 
 		 660 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  27.27 
 
 		 832 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1247 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  26.45 
 
 		 677 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  31.71 
 
 		 839 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  24.32 
 
 		 810 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1247 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  23.04 
 
 		 895 aa  43.1  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>