More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47702 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_10673  nuclear serine protease HtrA2/Nma111, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13650)  49.25 
 
 
1026 aa  924    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.138889 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47702  hypothetical signalling-associated PDZ domain containing protein  100 
 
 
983 aa  2028    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.849223  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0325  hypothetical protein  25.38 
 
 
491 aa  101  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  27.3 
 
 
520 aa  78.2  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  22.6 
 
 
471 aa  77  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  26.23 
 
 
524 aa  76.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  26.23 
 
 
524 aa  75.9  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  26.62 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  26.32 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.64 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.64 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.64 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  26.07 
 
 
353 aa  73.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  29.68 
 
 
473 aa  74.3  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  30.69 
 
 
387 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.07 
 
 
398 aa  74.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.3 
 
 
410 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  25.57 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  25.27 
 
 
495 aa  72.4  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  30.34 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  30.34 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  23.96 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  26.62 
 
 
488 aa  71.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  23.78 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  24.83 
 
 
365 aa  70.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  30 
 
 
402 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  29.73 
 
 
398 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  24.2 
 
 
471 aa  71.2  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  30 
 
 
402 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  30 
 
 
402 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  28.49 
 
 
528 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  25.85 
 
 
502 aa  69.7  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  27.59 
 
 
370 aa  70.1  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.46 
 
 
497 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  30 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  26.64 
 
 
496 aa  69.3  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.44 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  25 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  31.27 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.26 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  24.93 
 
 
464 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  25.77 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  29.66 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  23.97 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  26.14 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  24.09 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  26.01 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  25.33 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  27.44 
 
 
505 aa  68.2  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  26.53 
 
 
493 aa  67.8  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  27 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  24.86 
 
 
492 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.17 
 
 
388 aa  67.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  25.25 
 
 
374 aa  67.4  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  26.16 
 
 
483 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  27.95 
 
 
492 aa  67.4  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  24.8 
 
 
393 aa  67.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  25.34 
 
 
474 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  26.16 
 
 
483 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  26.53 
 
 
506 aa  67.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  30.5 
 
 
401 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.5 
 
 
401 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26 
 
 
426 aa  67  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  26.36 
 
 
487 aa  67  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  23.76 
 
 
389 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.5 
 
 
401 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  24.74 
 
 
489 aa  66.6  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  23.16 
 
 
409 aa  65.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  29.28 
 
 
396 aa  66.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  30.5 
 
 
401 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  24.09 
 
 
518 aa  65.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.5 
 
 
401 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  25.5 
 
 
462 aa  66.2  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  27.93 
 
 
404 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.5 
 
 
401 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  24.64 
 
 
471 aa  65.9  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.37 
 
 
496 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  24.59 
 
 
477 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  27.14 
 
 
392 aa  65.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  24.3 
 
 
467 aa  65.9  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 
394 aa  65.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  23.43 
 
 
459 aa  65.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  29.13 
 
 
474 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  27.93 
 
 
404 aa  65.1  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  24.57 
 
 
395 aa  64.7  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  25.86 
 
 
443 aa  64.7  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  23.06 
 
 
471 aa  64.7  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  24.04 
 
 
479 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  25.64 
 
 
527 aa  64.7  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  26.87 
 
 
493 aa  64.7  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  28.57 
 
 
465 aa  64.3  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  29.53 
 
 
407 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  24.3 
 
 
484 aa  64.3  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  23.14 
 
 
459 aa  64.3  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.08 
 
 
405 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  28.96 
 
 
491 aa  63.9  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  25.59 
 
 
424 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  29.92 
 
 
403 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  25.08 
 
 
471 aa  64.3  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.97 
 
 
415 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>