145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40271 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_40271  predicted protein  100 
 
 
446 aa  925    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03540  cytoplasm protein, putative  33.16 
 
 
379 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295039  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30832  predicted protein  30.71 
 
 
421 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.73505  normal  0.429862 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44549  predicted protein  30.75 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.425868  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10839  conserved hypothetical protein  25.8 
 
 
408 aa  96.7  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.366828  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70688  highly conserved oxidoreductase  25.63 
 
 
498 aa  76.6  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.743811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  23.88 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09356  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_3G02360)  24.38 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.809459  hitchhiker  0.00454333 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.34 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.08 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.61 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.61 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.15 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.61 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.88 
 
 
369 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.61 
 
 
369 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.61 
 
 
369 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.87 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.34 
 
 
369 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
482 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  25.56 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  26.58 
 
 
416 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  24.53 
 
 
363 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
363 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  24.74 
 
 
368 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  28.96 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4795  putative D-amino-acid dehydrogenase  27.42 
 
 
412 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  25.27 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  24.18 
 
 
371 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  24.18 
 
 
371 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  24.18 
 
 
371 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 
427 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  24.19 
 
 
371 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  23.15 
 
 
376 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  23.53 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 
425 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.19 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.19 
 
 
371 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 
375 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
364 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.84 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 
387 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  22.04 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 
415 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  24.15 
 
 
419 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.28 
 
 
382 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
415 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  21.61 
 
 
400 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 
396 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  26.34 
 
 
452 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  21.93 
 
 
367 aa  50.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  23.92 
 
 
371 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  33.33 
 
 
441 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  21.27 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 
500 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 
500 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  32.48 
 
 
316 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  38.71 
 
 
458 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.21 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0955  D-amino-acid dehydrogenase  44.9 
 
 
416 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.249989 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  22.01 
 
 
372 aa  47.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
418 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  20.66 
 
 
460 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  24.49 
 
 
419 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  23.08 
 
 
367 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  42.19 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  23.39 
 
 
371 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
371 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 
415 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
413 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 
417 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  24.94 
 
 
374 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
373 aa  46.6  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 
414 aa  46.6  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 
371 aa  46.6  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  23.39 
 
 
371 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  26.7 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 
496 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
819 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  50 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  23.5 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  32.39 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  39.39 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>