288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0704 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 179 aa  374  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  44.63 
 
 		 177 aa  141  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 194 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  35.91 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  37.22 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  37.5 
 
 		 194 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  38.04 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  33.51 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  35.2 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  35.2 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  35.2 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  35.2 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  35.2 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  35.2 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 197 aa  89  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  36.07 
 
 		 196 aa  88.6  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  35.2 
 
 		 616 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  32.21 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 177 aa  84.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  31.54 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  31.54 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  33.15 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  40.94 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.88 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.86 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  31.54 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  25.68 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.68 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.75 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.75 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  32.64 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.13 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  28.48 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 378 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.75 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  23.9 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  27.63 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>