68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5620 on replicon NC_011734
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  82.74 
 
 		 730 aa  1220    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  100 
 
 		 726 aa  1492    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  51.71 
 
 		 719 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  42.31 
 
 		 952 aa  197  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  40.6 
 
 		 952 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  42.79 
 
 		 501 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  43.28 
 
 		 506 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  44.44 
 
 		 974 aa  188  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  42.08 
 
 		 766 aa  185  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  37.15 
 
 		 498 aa  180  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  44.35 
 
 		 814 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  39.46 
 
 		 465 aa  178  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  36.52 
 
 		 544 aa  178  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  40.64 
 
 		 998 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  46.77 
 
 		 361 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  40.87 
 
 		 1025 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  39.32 
 
 		 982 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  40.17 
 
 		 968 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  39.33 
 
 		 1034 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  42.58 
 
 		 1039 aa  164  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  42.01 
 
 		 1034 aa  164  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  42.01 
 
 		 1006 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  39.26 
 
 		 1100 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  41.55 
 
 		 998 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  37.76 
 
 		 1107 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  38.52 
 
 		 1100 aa  157  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.25 
 
 		 1534 aa  157  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  37.27 
 
 		 673 aa  155  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  40.64 
 
 		 976 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  40.64 
 
 		 976 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  38.52 
 
 		 1123 aa  155  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  38.7 
 
 		 1000 aa  153  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  38.7 
 
 		 1000 aa  153  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  40 
 
 		 985 aa  153  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  41.83 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  37.45 
 
 		 1557 aa  152  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.05 
 
 		 1536 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  36.02 
 
 		 1356 aa  150  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  37.34 
 
 		 1102 aa  150  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  36.08 
 
 		 1170 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  39.38 
 
 		 498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  36.93 
 
 		 1102 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.66 
 
 		 1105 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  36.11 
 
 		 1538 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  36.36 
 
 		 1102 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  36.36 
 
 		 1095 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  38.72 
 
 		 407 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.15 
 
 		 1245 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.98 
 
 		 1098 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.98 
 
 		 1098 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  36.02 
 
 		 1107 aa  135  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  39.78 
 
 		 879 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0463  MobA/MobL protein  38.53 
 
 		 467 aa  134  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.0604865 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  39.23 
 
 		 881 aa  133  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p03  hypothetical protein  28.03 
 
 		 370 aa  107  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  32.44 
 
 		 1168 aa  105  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_010659  SbBS512_D0003  mobilization protein A  32.51 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.488217  n/a   
 
 
-
 
NC_011093  SeSA_C0004  43 kDa relaxation protein  31.45 
 
 		 511 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  33.33 
 
 		 310 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  38.97 
 
 		 160 aa  97.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004253  pDOJH10S_p2  Mob  29.84 
 
 		 492 aa  96.3  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3827  MobA/MobL protein  30.51 
 
 		 234 aa  95.1  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  34.39 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3939  MobA/MobL protein  33.85 
 
 		 414 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2819  MobA/MobL protein  24.91 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1193  MobA/MobL protein  25.59 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0900  MobA/MobL protein  25.59 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5322  hypothetical protein  42.42 
 
 		 97 aa  51.2  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642861  normal  0.725419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>