286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2282 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  55.51 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  56.88 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  56.88 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  55.51 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  56.42 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  54.25 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  53.74 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  53.27 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  53.27 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  53.27 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  53.27 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  53.27 
 
 		 230 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  53.24 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  58.91 
 
 		 228 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  58.91 
 
 		 228 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  58.91 
 
 		 275 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  58.91 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  58.71 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  52.34 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  50.86 
 
 		 236 aa  234  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  52.25 
 
 		 236 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  47.81 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  47.81 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  47.81 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  47.81 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  47.37 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  49.3 
 
 		 216 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  43.58 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  43.58 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  43.12 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  43.12 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.12 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  43.12 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  43.12 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  43.12 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1695  periplasmic pilus chaperone family protein  58.45 
 
 		 149 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  43.24 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  41.18 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  41.18 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  41.18 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  41.18 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  36.94 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  35.27 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.02 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  35.02 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  37.75 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  35.02 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  34.56 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  34.56 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  34.56 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  41.56 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  36.92 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  38.65 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  38.16 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.07 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  35.98 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  39.13 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  36.45 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  36.45 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  36.45 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  38.16 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  37.68 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  38.46 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  34.6 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  37.2 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  38.62 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  38.62 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  38.62 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  37.12 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.19 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  40.72 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.02 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.53 
 
 		 265 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  38.32 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.67 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  36.89 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  33.19 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  38.46 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  34.3 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  34.91 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.31 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  31.51 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  34.87 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.77 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.48 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.54 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  34.54 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  32.89 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  31.93 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.76 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  32.07 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.37 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  36.54 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  35.85 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  34.01 
 
 		 248 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  36.82 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  36.82 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  37.16 
 
 		 241 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>