More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3805 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3805  transketolase  100 
 
 		 662 aa  1345    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50819  transketolase  53.42 
 
 		 711 aa  699    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.21265  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0530  transketolase  59.94 
 
 		 677 aa  800    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  46.67 
 
 		 661 aa  597  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  46.97 
 
 		 660 aa  598  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  47.11 
 
 		 667 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  46.43 
 
 		 664 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  47.48 
 
 		 682 aa  568  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0131  transketolase  45.52 
 
 		 666 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  46.28 
 
 		 664 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  46.28 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  46.28 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  44.16 
 
 		 668 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  45.98 
 
 		 664 aa  558  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  45.83 
 
 		 664 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  45.83 
 
 		 664 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  45.93 
 
 		 664 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  47.19 
 
 		 661 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  44.31 
 
 		 668 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  45.98 
 
 		 663 aa  550  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  47.58 
 
 		 672 aa  551  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  45.44 
 
 		 674 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  45.44 
 
 		 674 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  45.37 
 
 		 662 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  46.68 
 
 		 675 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  44.31 
 
 		 666 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  45.58 
 
 		 665 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  44.31 
 
 		 680 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1497  transketolase  46.24 
 
 		 675 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  46.17 
 
 		 664 aa  542  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  44.8 
 
 		 668 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  46.23 
 
 		 664 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  47.86 
 
 		 668 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  46.23 
 
 		 664 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0910  transketolase  45.16 
 
 		 686 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  44.61 
 
 		 670 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  44.36 
 
 		 670 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  45.43 
 
 		 665 aa  541  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  44.16 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  44.16 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  44.31 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  46.07 
 
 		 664 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  45.52 
 
 		 662 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  44.16 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  44.66 
 
 		 666 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1034  transketolase  45.31 
 
 		 666 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  46.02 
 
 		 664 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  45.78 
 
 		 664 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  44.31 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  46.02 
 
 		 664 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  46.07 
 
 		 664 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  44.31 
 
 		 680 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3954  transketolase  45.85 
 
 		 664 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  45.51 
 
 		 663 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  45.51 
 
 		 663 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  47.18 
 
 		 665 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1308  transketolase  45.44 
 
 		 675 aa  536  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3480  transketolase  45.85 
 
 		 664 aa  535  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  45.51 
 
 		 663 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  45.51 
 
 		 663 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  47.14 
 
 		 692 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  44.46 
 
 		 666 aa  538  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  45.51 
 
 		 663 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  44.87 
 
 		 666 aa  538  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  45.51 
 
 		 663 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  45.22 
 
 		 692 aa  537  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  45.51 
 
 		 663 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  46.77 
 
 		 674 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  44.53 
 
 		 665 aa  532  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  45.14 
 
 		 711 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  45.36 
 
 		 663 aa  535  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  44.31 
 
 		 666 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  45.36 
 
 		 663 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  46.76 
 
 		 665 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  47.37 
 
 		 665 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  44.3 
 
 		 699 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  43.6 
 
 		 666 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  45.08 
 
 		 697 aa  533  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  44.11 
 
 		 666 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  47.57 
 
 		 678 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  44.95 
 
 		 668 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  44.87 
 
 		 712 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  46.28 
 
 		 669 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  47.07 
 
 		 665 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  45.72 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  45.54 
 
 		 711 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  45.72 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  42.81 
 
 		 662 aa  526  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  45.78 
 
 		 665 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  44.76 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  45.87 
 
 		 679 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  44.91 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0976  transketolase  46.11 
 
 		 664 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166447 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  44.91 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  44.95 
 
 		 662 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  44.48 
 
 		 665 aa  528  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  44.76 
 
 		 663 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  47.03 
 
 		 667 aa  527  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  43.5 
 
 		 662 aa  528  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  45.78 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>