More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3504 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 348 aa  684    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  42.69 
 
 		 342 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  30.95 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  28.65 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  35.19 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  28.03 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  28.44 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.49 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  34.16 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  28.61 
 
 		 368 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  34.29 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  31.5 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  27.05 
 
 		 354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  32.44 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  32.59 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  25.31 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  31.38 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  30.37 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  35.89 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  25.77 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  32.56 
 
 		 328 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  36.95 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  29.04 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  30.18 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.94 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  30.06 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.89 
 
 		 314 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  30.34 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  35.15 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  31.37 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  33.94 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  26.2 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  35.38 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  29.62 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.11 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  31.52 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  28.15 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  31.41 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  33.73 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  32.33 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  29.52 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  28.57 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  28.09 
 
 		 342 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  30.91 
 
 		 316 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 		 335 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  31.04 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  30.7 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  30.75 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  31.52 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  32.93 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  23.62 
 
 		 396 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.79 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  28.93 
 
 		 334 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  33.75 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  35.29 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  30.75 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  28.83 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28.18 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  30.7 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  29.5 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  25.47 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  30.25 
 
 		 319 aa  92.8  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  29 
 
 		 335 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  29.62 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  29.34 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  32.19 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3563  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  27.88 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  28.26 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  27.71 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  29.15 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  29.11 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  28.9 
 
 		 340 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  29.88 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  28.29 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  27.53 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  29.94 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4078  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  27.78 
 
 		 324 aa  86.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  32.9 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  26.19 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  29.71 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  28.71 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  28.01 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  26.65 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  33.65 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.25 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  29.56 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  29.44 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  23.15 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  28.01 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  31.36 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  28.74 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  29.3 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  30.9 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>