More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0438 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0438  response regulator receiver protein  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  36.75 
 
 
882 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
1023 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 
997 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
997 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1193 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1023 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
983 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.2 
 
 
890 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
1184 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
1184 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
860 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
886 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
619 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
893 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
810 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
531 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
869 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
829 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
973 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
946 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.06 
 
 
916 aa  68.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 
822 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3293  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
692 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
817 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
226 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
886 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.58 
 
 
249 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
540 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.07 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
882 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.34 
 
 
989 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 
1260 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  27.12 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 
630 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  32.5 
 
 
866 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 
821 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.81 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2507  winged helix family two component transcriptional regulator  34.48 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
1260 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
942 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
870 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 
231 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 
224 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  36.62 
 
 
252 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 
224 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
869 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
714 aa  63.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1752  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 
228 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
1070 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
712 aa  63.5  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
1070 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 
225 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 
244 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  28.28 
 
 
378 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  30.25 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  30.25 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  30.25 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 
226 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 
232 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  30.25 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  30.25 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2469  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.34 
 
 
655 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344805  normal  0.830162 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  31.03 
 
 
226 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  30.25 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.19 
 
 
576 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 
234 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  30.25 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  30.25 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
812 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 
238 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  30.25 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  31.71 
 
 
367 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  32.2 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  30.25 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 
239 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 
239 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  31.82 
 
 
242 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 
642 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1789  alkaline phosphatase synthesis response regulator  28.45 
 
 
229 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 
238 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 
943 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 
342 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 
234 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
872 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
802 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  29.75 
 
 
263 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  32.76 
 
 
824 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0898  DNA-binding response regulator  25.2 
 
 
234 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  28.1 
 
 
200 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
846 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
654 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 
227 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  31.91 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.33 
 
 
234 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.58 
 
 
234 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>